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基因数据分析软件迁移-rMATS-4.1.0
项目说明服务器TaiShan 200服务器（型号2280）CPU鲲鹏920 5250处理器内存无要求存储无要求磁盘分区/top空间建议保留100G+网络能访问互联网操作系统CentOS 7.6前提条件，推荐安装gcc5.4.0环境，必须R语言环境安装依赖yum install -y python-devel gsl-devel blas blas-devel lapack lapack-de...
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作者小头像 phluo 2022-01-20 10:49:21
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基因数据分析软件迁移-Kobas3
项目说明服务器TaiShan 200服务器（型号2280）CPU鲲鹏920 5250处理器内存无要求存储无要求磁盘分区/top空间建议保留100G+网络能访问互联网操作系统CentOS 7.6前提条件，安装好R语言环境SQLite安装yum install -y sqlite sqlite-develPySQLite安装2.1 安装系统依赖yum install -y python-deve...
基因测序
作者小头像 phluo 2022-01-19 11:49:43
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基因数据分析软件迁移-HTSeq
项目说明服务器TaiShan 200服务器（型号2280）CPU鲲鹏920 5250处理器内存无要求存储无要求磁盘分区/top空间建议保留100G+网络能访问互联网操作系统CentOS 7.6安装依赖-numpy,pysam,cythonpip install numpy -i https://pypi.tuna.tsinghua.edu.cn/simple --trusted-host p...
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作者小头像 phluo 2022-01-19 11:29:18
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基因数据分析软件迁移-bowtie2
项目说明服务器TaiShan 200服务器（型号2280）CPU鲲鹏920 5250处理器内存无要求存储无要求磁盘分区/top空间建议保留100G+网络能访问互联网操作系统CentOS 7.6下载软件包wget https://master.dl.sourceforge.net/project/bowtie-bio/bowtie2/2.4.5/bowtie2-2.4.5-linux-aarc...
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作者小头像 phluo 2022-01-19 11:25:22
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基因数据分析软件迁移-stringtie
项目说明服务器TaiShan 200服务器（型号2280）CPU鲲鹏920 5250处理器内存无要求存储无要求磁盘分区/top空间建议保留100G+网络能访问互联网操作系统CentOS 7.6安装依赖yum install -y git autoconf下载软件wget http://ccb.jhu.edu/software/stringtie/dl/stringtie-2.2.0.tar....
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作者小头像 phluo 2022-01-19 11:17:43
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基因数据分析软件迁移-cutadapt
项目说明服务器TaiShan 200服务器（型号2280）CPU鲲鹏920 5250处理器内存无要求存储无要求磁盘分区/top空间建议保留100G+网络能访问互联网操作系统CentOS 7.6安装系统依赖yum install -y python-devel安装cutadaptpip install cutadapt验证3. 验证
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作者小头像 phluo 2022-01-19 11:15:07
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基因数据分析软件迁移-cicros
项目说明服务器TaiShan 200服务器（型号2280）CPU鲲鹏920 5250处理器内存无要求存储无要求磁盘分区/top空间建议保留100G+网络能访问互联网操作系统CentOS 7.6安装系统依赖yum install expat-devel perl-CPAN gd gd-devel.aarch64 -y安装perl模块cpan App::cpanminuscpanm --mirr...
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作者小头像 phluo 2022-01-19 11:07:14
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基因数据分析软件迁移-Sequenza
项目说明服务器TaiShan 200服务器（型号2280）CPU鲲鹏920 5250处理器内存无要求存储无要求磁盘分区/top空间建议保留100G+网络能访问互联网操作系统CentOS 7.6前提条件，安装好R语言环境安装R包依赖，进入R控制台install.pakages(“pbapply”)install.packages("squash")install.packages("iotoo...
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作者小头像 phluo 2022-01-19 10:59:13
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基因数据分析软件迁移-FACETS
项目说明服务器TaiShan 200服务器（型号2280）CPU鲲鹏920 5250处理器内存无要求存储无要求磁盘分区/top空间建议保留100G+网络能访问互联网操作系统CentOS 7.6前提条件，安装好R语言环境安装依赖libgit21.2 下载软件包wget https://github.com/libgit2/libgit2/archive/main.zip -O libgit2-...
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作者小头像 phluo 2022-01-19 10:54:10
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基因数据分析软件迁移-Sambamba-0.7.0
项目说明服务器TaiShan 200服务器（型号2280）CPU鲲鹏920 5250处理器内存无要求存储无要求磁盘分区/top空间建议保留100G+网络能访问互联网操作系统CentOS 7.6系统依赖安装yum install libconfig libconfig-devel python3-devel cmake3 -y1.1 如果系统pagesize修改为4k，需要源码安装libcon...
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作者小头像 phluo 2022-01-19 10:39:28
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