基因数据分析软件迁移-FACETS
【摘要】 项目说明服务器TaiShan 200服务器（型号2280）CPU鲲鹏920 5250处理器内存无要求存储无要求磁盘分区/top空间建议保留100G+网络能访问互联网操作系统CentOS 7.6前提条件，安装好R语言环境安装依赖libgit21.2 下载软件包wget https://github.com/libgit2/libgit2/archive/main.zip -O libgit2-...
| 项目 | 说明 |
|---|---|
| 服务器 | TaiShan 200服务器（型号2280） |
| CPU | 鲲鹏920 5250处理器 |
| 内存 | 无要求 |
| 存储 | 无要求 |
| 磁盘分区 | /top空间建议保留100G+ |
| 网络 | 能访问互联网 |
| 操作系统 | CentOS 7.6 |
前提条件，安装好R语言环境
- 安装依赖libgit2
1.2 下载软件包
wget https://github.com/libgit2/libgit2/archive/main.zip -O libgit2-main.zip
1.3 解压软件包
unzip libgit2-main.zip
1.4 进入解压目录
cd libgit2-main/
1.5 编译安装
mkdir build && cd build
cmake ..
cmake --build .
cmake --build . --target install - 安装FACETS
2.1 安装R依赖
wget https://api.github.com/repos/veseshan/pctGCdata/tarball/HEAD
R CMD INSTALL veseshan-pctGCdata-d2d4faf.tar.gz
2.2 安装FACETS
wget https://api.github.com/repos/mskcc/facets/tarball/HEAD
R CMD INSTALL mskcc-facets-v0.5.14-18-g59835bb.tar.gz
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