基因数据分析软件迁移-Sequenza

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phluo 发表于 2022/01/19 10:59:13 2022/01/19
【摘要】 项目说明服务器TaiShan 200服务器(型号2280)CPU鲲鹏920 5250处理器内存无要求存储无要求磁盘分区/top空间建议保留100G+网络能访问互联网操作系统CentOS 7.6前提条件,安装好R语言环境安装R包依赖,进入R控制台install.pakages(“pbapply”)install.packages("squash")install.packages("iotoo...
项目 说明
服务器 TaiShan 200服务器(型号2280)
CPU 鲲鹏920 5250处理器
内存 无要求
存储 无要求
磁盘分区 /top空间建议保留100G+
网络 能访问互联网
操作系统 CentOS 7.6

前提条件,安装好R语言环境

  1. 安装R包依赖,进入R控制台
    install.pakages(“pbapply”)
    install.packages("squash")
    install.packages("iotools")
    install.packages("readr")
    install.packages("seqminer")
    install.packages("BiocManager")
    library("BiocManager")
    BiocManager::install('copynumber')
  2. 下载软件包
    wget https://github.com/cran/sequenza/archive/refs/tags/3.0.0.tar.gz -O sequenza-3.0.0.tar.gz
  3. 安装
    R CMD INSTALL sequenza-3.0.0.tar.gz
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