基因数据分析软件迁移-rMATS-4.1.0
【摘要】 项目说明服务器TaiShan 200服务器（型号2280）CPU鲲鹏920 5250处理器内存无要求存储无要求磁盘分区/top空间建议保留100G+网络能访问互联网操作系统CentOS 7.6前提条件，推荐安装gcc5.4.0环境，必须R语言环境安装依赖yum install -y python-devel gsl-devel blas blas-devel lapack lapack-de...
| 项目 | 说明 |
|---|---|
| 服务器 | TaiShan 200服务器（型号2280） |
| CPU | 鲲鹏920 5250处理器 |
| 内存 | 无要求 |
| 存储 | 无要求 |
| 磁盘分区 | /top空间建议保留100G+ |
| 网络 | 能访问互联网 |
| 操作系统 | CentOS 7.6 |
前提条件，推荐安装gcc5.4.0环境，必须R语言环境
- 安装依赖
yum install -y python-devel gsl-devel blas blas-devel lapack lapack-devel git
pip install -i https://pypi.tuna.tsinghua.edu.cn/simple cython --trusted-host pypi.tuna.tsinghua.edu.cn
pip install -i https://pypi.tuna.tsinghua.edu.cn/simple numpy --trusted-host pypi.tuna.tsinghua.edu.cn - 下载软件包
Wget https://github.com/Xinglab/rmats-turbo/releases/download/v4.1.0/rmats_turbo_v4_1_0.tar.gz - 解压软件包
tar -xf rmats_turbo_v4_1_0.tar.g - 修改rmats-turbo-4.1.0/rMATS_C/Makefile如下：
- 执行编译安装
./build_rmats
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