AI制药公司系列之一：Insilico Medicine

YMKD

• 数字化创新部的AI制药岗位。
• 大部门主要做AI和数字化运营。
• 数字化运营可以做一些数字转型的工作文档，里外啊等等。
• 因为药明康德是CRO，基本是合成化合物后的工作。
• 例如别人有个化合物，我们要帮忙合成。
• 主要是拿到化合物后的工作。
• 之前的不太做。
•  那也要通过AI制药的方式去看是否能合成啊，或者合成设计是否更高效的。
• 这个里面有很多子课题能够去做。
• 例如一些预训练啊，一些表示方式啊等等。
• 团队有20人，大部门有50人。计算机的，化学的，数学的材料，物理的，化学信息，学的计算，生物的。
• 希望招的人有一定技术实力，能够深入做科研，同时也有一些工程能力，愿意就一个问题深入研究。
• 理解这个部门有点类似搞科研，把一个问题深入的细致研究。
  

MT

他们对人的需求

背景

• 计算机背景出身的，计算机背景是基本功

• 有一些医学背景是加分项。

• 自己团队并不是最强性的需求。

算法基本

• 互联网的研发，leetcode是个门槛。
• 先考察deep learning的知识，编程知识以及其他的软性，作为基本项。
• 然后对于医学背景数学的理解是加分项。
• 知识图谱是由产品和运营团队去定义，算法团队基于三元组去做graph的东西。
• 负责医药知识图谱和智能辅助诊断。
• 分为不同的小组，不同的人做。
• graph embedding做深入。

工作

• 做之前定义好场景和指标，
• 化学的同事，去做评测集的建设。
• 如何标注如何生产？如何发布评测集？
• 然后做一些库存预测的东西。
• #300 最长递增子序列

 DERUI

• 晶泰：晶体预测，偏后期；19年新药发现，类似CRO。
• Insilico: 在澳大利亚做，肺纤维化的临床试验
• 德睿：（1）与外部合作，外部有靶点，找化合物等；deviler分子等，到PCC阶段preclinical candidate。
• （2）外部管线等，两个分子做到PCC，十几个在内部关系，其他公司合作的也有10多个在管线。
• （3）平台：一站式开发，涵盖早期的ADMET预测等，30多种性质预测，还要做RANK平台等

• 主要使用图网络的方法，通过与外部对比，与一些商业软件对比（ADMET Predictor等)，
• 前期会基于数据做大量清洗工作，而且要根据试验的方法来，例如溶解度不太一样，不同条件很不一样。
• 主要做的方向：蛋白结构预测、分子生成分析及分子性质预测等。
• 个人发展：跟着管线走，逐渐了解哪些要点，了解实验方法原理等。不同学科的人有交流机会等。
• 生物的有一些基础也还好，可以逐渐学明白。

BJ-Last

• 团队的需求，RNA therepy.
• 对于未来的计划，
• 能力比较匹配
•  做的程度，去年开始做的，HUA去年的。
• 觉得AI药物的效果怎么样？
• 对你们这个部门的发展计划，扩展到10人左右。
• （从200多人到700多人，重视研发等）
•  CADD的人其实不区分的，可以都做。
• 从公司角度看小分子占大多数，大分子比较少。
•  因为小分子的设计成分比较多，需要AI参与设计。
• 大分子的话，设计成分可能比较少，更多依靠人。
•  不同专业的人结合起来，发挥优势。
•  靶点发现方面需要做些工作。
  • 建立一个复杂的靶点地图，能够关注其他药物公司正在研究的靶点，这方面可以用到文献挖掘技术。
  • 同时长期来看，要去找一些全新的靶点，自主去发现。
•  之后要做大规模的虚拟筛选，希望对300亿的化合物，做大规模筛选。
•  再之后是做一些admet和毒性预测等，这方面比较依赖数据。
•  
• 同时也有一些其他的组希望CADD的人能提供帮助，比如说RNA治疗。
• 希望AI团队发展到10几人规模
•  
• 上海主要是大分子的人
  

 Juns

• siRNA药物的设计
  • HPV病人
  • 乙肝基因组，保守区段分析；
• siRNA有一些常规的方法
  • HPV基因组和肝癌发病率
  • siRNA序列评分，确定
• 方式
  • 里程碑付款
  • • 使用平台，一年费用
  • • 单纯一次买断，咨询服务
  • 周期拿到初步的内容；
  • 维护服务。一个月左右，3-4个月左右。