基因数据分析软件迁移-scvelo
【摘要】 项目说明服务器TaiShan 200服务器（型号2280）CPU鲲鹏920 5250处理器内存无要求存储无要求磁盘分区/top空间建议保留100G+网络能访问互联网操作系统Kylin Linux Advanced Server V10 (Tercel)安装依赖yum install hdf5 hdf5-devel blosc blosc-devel -ypip install cython ...
| 项目 | 说明 |
|---|---|
| 服务器 | TaiShan 200服务器（型号2280） |
| CPU | 鲲鹏920 5250处理器 |
| 内存 | 无要求 |
| 存储 | 无要求 |
| 磁盘分区 | /top空间建议保留100G+ |
| 网络 | 能访问互联网 |
| 操作系统 | Kylin Linux Advanced Server V10 (Tercel) |
- 安装依赖
yum install hdf5 hdf5-devel blosc blosc-devel -y
pip install cython -i https://pypi.tuna.tsinghua.edu.cn/simple - 安装lzo2,下载源码到本地目录
wget https://github.com/damageboy/lzo2/archive/refs/heads/master.zip - 解压软件包
unzip master.zip - 进入解压目录
cd lzo2-master - 执行编译安装
./configure --enable-shared=yes && make -j 16 && make install - 安装scvelo
pip install scvelo -i https://pypi.tuna.tsinghua.edu.cn/simple - 备注：
此报错表示hdf5依赖未安装
此报错表示需要安装numpy和pyparsing，并且需要安装对应版本
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