基因数据分析软件迁移-FACETS

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phluo 发表于 2021/11/11 16:53:27 2021/11/11
【摘要】 项目说明服务器TaiShan 200服务器(型号2280)CPU鲲鹏920 5250处理器内存无要求存储无要求磁盘分区/top空间建议保留100G+网络能访问互联网操作系统Kylin Linux Advanced Server V10 (Tercel)下载软件包到本地wget https://github.com/mskcc/facets/archive/refs/tags/v0.6.2.t...
项目 说明
服务器 TaiShan 200服务器(型号2280)
CPU 鲲鹏920 5250处理器
内存 无要求
存储 无要求
磁盘分区 /top空间建议保留100G+
网络 能访问互联网
操作系统 Kylin Linux Advanced Server V10 (Tercel)
  1. 下载软件包到本地
    wget https://github.com/mskcc/facets/archive/refs/tags/v0.6.2.tar.gz -o facets-0.6.2.tar.gz
  2. 安装软件包:(linux 命令行执行)
    R CMD INSTALL facets-0.6.2.tar.gz
    image.png
  3. 依赖于pctGCdata,下载软件包
    wget https://github.com/veseshan/pctGCdata/archive/refs/tags/v0.3.0.tar.gz -o pctGCdata-0.3.0.tar.gz
  4. 安装pctGCdata
    R CMD INSTALL pctGCdata-0.3.0.tar.gz
  5. 再次执行步骤2,安装facets
  6. 验证
    library(“facets”)
    image.png
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