基因数据分析软件迁移-GATK
【摘要】 项目说明服务器TaiShan 200服务器（型号2280）CPU鲲鹏920 5250处理器内存无要求存储无要求磁盘分区/top空间建议保留100G+网络能访问互联网操作系统Kylin Linux Advanced Server V10 (Tercel)安装依赖yum install -y git-lfs下载源码包git clone https://github.com/broadinstit...
| 项目 | 说明 |
|---|---|
| 服务器 | TaiShan 200服务器（型号2280） |
| CPU | 鲲鹏920 5250处理器 |
| 内存 | 无要求 |
| 存储 | 无要求 |
| 磁盘分区 | /top空间建议保留100G+ |
| 网络 | 能访问互联网 |
| 操作系统 | Kylin Linux Advanced Server V10 (Tercel) |
- 安装依赖
yum install -y git-lfs - 下载源码包
git clone https://github.com/broadinstitute/gatk.git - 执行编译构建
./gradlew bundle - 编译成功标识
- 安装，将以上结果拷贝到需要安装的主机，解压目录
unzip gatk-4.2.2.0-22-gf3df0b3-SNAPSHOT.zip - 修改目录名称
mv gatk-4.2.2.0-22-gf3df0b3-SNAPSHOT gatk-4.2.20-22 - 设置环境变量
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