百度飞桨(PaddlePaddle)分布式训练在Volcano系统上的实践(上)
飞桨(PaddlePaddle)是百度于2016年9月开源的深度学习框架,旨在提供一款安全高效、灵活易用、可扩展的深度学习平台。
2018年10月,飞桨团队发布Paddle Fluid 1.0版本,对神经网络描述、大规模分布式训练、高性能推理引擎等核心能力进行了全面升级。以工业界应用必需的分布式训练能力为例,在最新的Paddle Fluid 1.5.2版本中,飞桨支持数据并行、模型并行、流水线并行等多种并行模式,参数服务器架构和点对点同步训练架构全面支持在CPU、GPU等硬件资源设备上的大规模训练。本文将介绍飞桨分布式训练在Kubernetes社区中的Volcano系统上进行实践的案例。
Kubernetes是当今最火的容器化应用自动部署、伸缩和资源管理的开源系统。随着Kubernetes的崛起,越来越多的公司愿意将自己的业务应用部署在Kubernetes上。除了典型的Web服务、数据库等服务会基于Kubernetes进行部署以外,深度学习框架的分布式训练也不例外。
然而,在Kubernetes系统中提交深度学习训练任务的功能并不像传统的高性能计算MPI平台那样直观。在2017年,Kubernetes社区就有文章Run Deep Learning with PaddlePaddle on Kubernetes分析了运行PaddlePaddle对底层资源的诉求,基于PaddlePaddle对计算容错性、弹性伸缩、资源隔离的要求,提出在Kubernetes平台上运行PaddlePaddle是最佳实践。
自Paddle Fluid 1.0 发布以来,飞桨在平台部署和任务调度管理上已经取得了长足的进步。借助Kubernetes平台,飞桨可以实现CPU/GPU等硬件资源的合理调度分配、训练任务的弹性扩缩容,并能显著提升计算资源的利用率。但是,在并行创建和调度任务、训练任务的生命周期管理、计算资源亲和性调度、调度策略优化等方面还有提升空间。为了提升飞桨框架的计算效率,飞桨团队和Volcano团队联合发布PaddlePaddle on Volcano方案。
Volcano是一款构建于Kubernetes之上的增强型高性能计算任务批量处理系统。
作为一个面向高性能计算场景的平台,它弥补了kubernetes 在机器学习、深度学习、HPC、大数据计算等场景下的基本能力缺失,其中包括gang-schedule的调度能力、计算任务队列管理、GPU亲和性调度。另外,Volcano在原有Kubernetes能力基础上对计算任务的批量创建及生命周期管理、Fair-share调度等方面做了增强。
Volcano平台可以满足飞桨对资源创建,资源调度的基本要求。Volcano的批量创建批量调度计算任务为飞桨作业提供计算任务的自动化生命周期管理,gang-scheduler调度策略可以满足PServer和Trainer “all or nothing”的业务调度约束,Queue和priority逻辑可以管理集群下计算作业的执行顺序,Fair-share和GPU亲和度调度使计算任务调度更贴合PServer和Trainer对节点资源和网络拓扑结构的要求而提升任务计算效率。
Volcano借助Kubernetes创建CRD能力,在Kubernetes中引入“apiVersion”为“batch.volcano.sh/v1alpha1”,“kind”为“Job”的资源对象,用于描述计算任务。通过配置和创建Volcano job可以使用Volcano平台创建、管理和调度计算任务。使用volcano平台,需要先在Kubernetes集群下安装Volcano,安装Volcano的方法可参考Volcano 官网。
选择一个飞桨框架任务分别使用Kubernetes原生资源和Volcano job执行计算任务并对比分析,以下对比将着重体现两者在使用方法、任务管理、调度策略方面进行比较。选择飞桨官网分布式训练CTR(Click-Through-Rate) demo进行对比测试。CTR demo将运行两个PServer任务和两个Trainer任务。
首先使用飞桨官网推荐模式执行分布式计算任务,先创建一个副本数为2的Kubernetes ReplicaSet对象,用于运行PServer业务,然后创建一个并行度为2的Kubernetes Job对象,用于运行Trainer任务。
创建PServer任务:
root@volcano-paddlepaddle:~# kubectl apply -f pserver.yaml
replicaset.extensions/fluid-ctr-pserver create
查看pserver ReplicaSet组件:
root@volcano-paddlepaddle:~# kubectl get rs
NAME DESIRED CURRENT READY AGE
fluid-ctr-pserver 2 2 2 5
查看pserver pods:
root@volcano-paddlepaddle:~# kubectl get pods | grep fluid
fluid-ctr-pserver-b9w99 1/1 Running 0 9m18s
fluid-ctr-pserver-pb9vd 1/1 Running 0 9m18
查看pserver日志,PServer已经开始工作,并对外提供服务:
root@volcano-paddlepaddle:~# kubectl logs fluid-ctr-pserver-b9w99
+ case "$1"in
+ start_fluid_process
+ pserver_label=paddle-job-pserver=fluid-ctr
+ trainer_label=paddle-job=fluid-ct
+ hostname=c-rlnrdybm-muamumvq-1
+ task_index=
+ '[' PSERVER == TRAINER ']
+ '[' PSERVER == PSERVER ']'
+ stdbuf -oL python /root/k8s_tools.py wait_pods_running paddle-job-pserver=fluid-ctr 2
label selector: paddle-job-pserver=fluid-ctr, desired: 2
current cnt: 0 sleep for 5 seconds...
+ '[' PSERVER == TRAINER ']'
+ '[' PSERVER == WORKER ']
++ python /root/k8s_tools.py fetch_endpoints paddle-job-pserver=fluid-ctr 30236
+ export PADDLE_PSERVERS=192.168.48.24:30236,192.168.48.25:30237
+ PADDLE_PSERVERS=192.168.48.24:30236,192.168.48.25:30237
++ python /root/k8s_tools.py fetch_ips paddle-job=fluid-ctr
+ export PADDLE_TRAINER_IPS=
+ PADDLE_TRAINER_IPS=
+ '[' PSERVER == TRAINER ']'
+ '[' PSERVER == WORKER ']'
++ python /root/k8s_tools.py fetch_id paddle-job-pserver=fluid-ctr
+ task_index=0
+ export PADDLE_TRAINER_ID=0
+ PADDLE_TRAINER_ID=0
+ export PADDLE_PSERVER_ID=0
+ PADDLE_PSERVER_ID=0
+ stdbuf -oL sh -c 'cd /workspace/ctr && python train.py --is_local 0 --cloud_train 1'
2019-09-03 06:43:10,661 - INFO - run dist training
2019-09-03 06:43:10,715 - INFO - run pserver
get_pserver_program() is deprecated, call get_pserver_programs() to get pserver main and startup in a single call.
I0903 06:43:10.826609 41 grpc_server.cc:435] Server listening on 192.168.48.24:30236 selected port:
创建trainer任务:
root@volcano-paddlepaddle:~# kubectl apply -f trainer.yaml
job.batch/fluid-ctr-trainer create
查看trainer pods
root@volcano-paddlepaddle:~# kubectl get pod | grep fluid
fluid-ctr-pserver-b9w99 1/1 Running 0 87m
fluid-ctr-pserver-pb9vd 1/1 Running 0 87m
fluid-ctr-trainer-lg9n5 1/1 Running 0 12s
fluid-ctr-trainer-tvr99 1/1 Running 0 12
查看trainer任务日志,看到任务已经开始执行:
root@volcano-paddlepaddle:~# kubectl logs fluid-ctr-trainer-lg9n5
+ case "$1" in
+ start_fluid_process
+ pserver_labe=paddle-job-pserver=fluid-ctr
+ trainer_label=paddle-job=fluid-ctr
+ hostname=c-rlnrdybm-muamumvq-2
+ task_index=
+ '[' TRAINER == TRAINER ']'
+ stdbuf -oL python /root/k8s_tools.py wait_pods_running paddle-job-pserver=fluid-ctr 2
label selector: paddle-job-pserver=fluid-ctr, desired: 2
+ '[' TRAINER == TRAINER ']'
+ stdbuf -oL python /root/k8s_tools.py wait_pods_running paddle-job=fluid-ctr 2
label selector: paddle-job=fluid-ctr, desired: 2
++ python /root/k8s_tools.py fetch_endpoints paddle-job-pserver=fluid-ctr 30236
+ export PADDLE_PSERVERS=192.168.48.24:30236,192.168.48.25:30237
+ PADDLE_PSERVERS=192.168.48.24:30236,192.168.48.25:30237
++ python /root/k8s_tools.py fetch_ips paddle-job=fluid-ctr
+ export PADDLE_TRAINER_IPS=192.168.48.24,192.168.48.25
+ PADDLE_TRAINER_IPS=192.168.48.24,192.168.48.25
+ '[' TRAINER == TRAINER ']'
+ check_failed_cnt 1
+ max_failed=1
++ python /root/k8s_tools.py count_pods_by_phase paddle-job=fluid-ctr Failed
+ failed_count=0
+ '[' 0-gt 1 ']'
++ python /root/k8s_tools.py fetch_id paddle-job=fluid-ctr
+ task_index=0
+ export PADDLE_TRAINER_ID=0
+ PADDLE_TRAINER_ID=0
+ export PADDLE_PSERVER_ID=0
+ PADDLE_PSERVER_ID=0
+ stdbuf -oL sh -c 'cd /workspace/ctr && python train.py --is_local 0 --cloud_train 1'
2019-09-03 08:10:20,888 - INFO - run dist training
2019-09-03 08:10:20,951 - INFO - download the training materials
% Total % Received % Xferd Average Speed Time Time Time Current
Dload Upload Total Spent Left Speed
100 433M 100 433M 0 0 70.9M 0 0:00:06 0:00:06 --:--:-- 97.0M
2019-09-03 08:11:04,522 - INFO - run trainer
2019-09-03 08:11:04,591 - WARNING -
I0903 08:11:04.594007 25 parallel_executor.cc:329] The number of CPUPlace, which is used in ParallelExecutor, is 2. And the Program will be copied 2 copies
I0903 08:11:04.875757 25 rpc_client.h:101] init rpc client with trainer_id 0
2019-09-03 08:11:38,625 - INFO - TRAIN --> pass: 0 batch: 0 loss: 0.697331115723 auc: 0.500826068453, batch_auc: 0.500826068453
2019-09-03 08:11:38,967 - INFO - TRAIN --> pass: 0 batch: 1 loss: 0.652093688965 auc: 0.48451329672, batch_auc: 0.48451329672
2019-09-03 08:11:39,242 - INFO - TRAIN --> pass: 0 batch: 2 loss: 0.629092956543 auc: 0.485173881519, batch_auc: 0.485173881519
2019-09-03 08:11:39,577 - INFO - TRAIN --> pass: 0 batch: 3 loss: 0.603850708008 auc: 0.482131778494, batch_auc: 0.482131778494
2019-09-03 08:11:39,874 - INFO - TRAIN --> pass: 0 batch: 4 loss: 0.591485412598 auc: 0.479737304993, batch_auc: 0.479737304993
2019-09-03 08:11:40,133 - INFO - TRAIN --> pass: 0 batch: 5 loss: 0.58376159668 auc: 0.478554220739, batch_auc: 0.478554220739
2019-09-03 08:11:40,385 - INFO - TRAIN --> pass: 0 batch: 6 loss: 0.561969116211 auc: 0.481465857424, batch_auc: 0.481465857424
2019-09-03 08:11:40,637 - INFO - TRAIN --> pass: 0 batch: 7 loss: 0.557065185547 auc: 0.486014931119, batch_auc: 0.486014931119
2019-09-03 08:11:40,890 - INFO - TRAIN --> pass: 0 batch: 8 loss: 0.562498413086 auc: 0.489651573333, batch_auc: 0.489651573333
2019-09-03 08:11:41,158 - INFO - TRAIN --> pass: 0 batch: 9 loss: 0.566428283691 auc: 0.489853260221, batch_auc: 0.49137884426
2019-09-03 08:11:41,452 - INFO - TRAIN --> pass: 0 batch: 10 loss: 0.564840087891 auc: 0.492880386228, batch_auc: 0.494013763938
2019-09-03 08:11:41,742 - INFO - TRAIN --> pass: 0 batch: 11 loss: 0.564809204102 auc: 0.493201528907, batch_auc: 0.498872381582
2019-09-03 08:11:42,056 - INFO - TRAIN --> pass: 0 batch: 12 loss: 0.584479736328 auc: 0.494151972036, batch_auc: 0.503926628391
2019-09-03 08:11:42,329 - INFO - TRAIN --> pass: 0 batch: 13 loss: 0.615677246094 auc: 0.49252557362, batch_auc: 0.5028352489
等待trainer任务执行完成,查看pserver和trainer pods状态,trainer已经执行完成,pserver仍然于运行中:
root@volcano-paddlepaddle:~# kubectl get pods | grep fluid
fluid-ctr-pserver-b9w99 1/1 Running 0 177m
fluid-ctr-pserver-pb9vd 1/1 Running 0 177m
fluid-ctr-trainer-lg9n5 0/1 Completed 0 90m
fluid-ctr-trainer-tvr99 0/1 Completed 0 90
百度飞桨(PaddlePaddle)分布式训练在Volcano系统上的实践(下)
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