在MRS集群中使用Python3.7运行PySpark程序，调用RDD的take函数报错处理

现象

如果我们安装了python3.7版本来运行spark，并且用到了RDD的take函数，就会报错：

RuntimeError: generator raised StopIteration

我们可以编写一个python脚本test.py来进行测试，用spark-submit命令提交： spark-submit test.py

from pyspark.sql import SparkSession

spark = SparkSession\
    .builder\
    .appName("PythonWordCount")\
    .getOrCreate()

sc = spark.sparkContext
print(sc.parallelize([1, 2]).take(1))

当然也可以直接在pyspark的交互式shell中执行

 sc.parallelize([1, 2]).take(1)

执行就会碰到上面说的错误。

原因分析

这个错误是由于Python3.7合入了一个不兼容性修改PEP-0479引起的。

Spark社区已经修复并合入了Spark的2.3.2和2.4版本，具体参考Spark对应的JIRA SPARK-24739。

解决方法

MRS目前使用的版本为Spark 2.2.1，尚未修复。目前可以通过两种方法规避：

1. （推荐）使用Python 3.6，3.5；

2.  参考开源合入，修改提交任务节点的对应python脚本，并打包。具体见下一节。

参考开源合入，修改不兼容的python代码

开源合入链接，[SPARK-24739][PYTHON] Make PySpark compatible with Python 3.7

打开客户端节点，修改/opt/client/Spark/spark/python/pyspark/rdd.py中的takeUpToNumLeft方法。

def takeUpToNumLeft(iterator):
    iterator = iter(iterator)
    taken = 0
    while taken < left:
        try:
            yield next(iterator)
        except StopIteration:
            return
        taken += 1

重新打包pyspark.zip

# 备份pyspark.zip
cd /opt/client/Spark/spark/python/lib && mv pyspark.zip pyspark.zip.bak

# 打包新的pyspark.zip
cd /opt/client/Spark/spark/python; zip -r pyspark.zip pyspark

# 移动至lib目录
mv pyspark.zip /opt/client/Spark/spark/python/lib/

# 修改权限
chmod 777 /opt/client/Spark/spark/python/lib/pyspark.zip

这时再来试一下。

spark-submit test.py
或者
spark-submit --master yarn test.py

额外说一点，使用pyspark shell，使用的是未打包的python，就是/opt/client/Spark/spark/python/pyspark/xxx.py；使用spark-submit命令提交，用的就是lib目录下的pyspark.zip了，具体可以看下面这一行上传的日志。

2018-12-18 16:24:05,888 | INFO  | Thread-3 | Uploading resource file:/opt/client/Spark/spark/python/li
b/pyspark.zip -> hdfs://hacluster/user/hdfs/.sparkStaging/application_1545119010002_0007/pyspark.zip |
 org.apache.spark.internal.Logging$class.logInfo(Logging.scala:54)