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生物医药领域-分子对接SOTA模型洞察
该洞察介绍了分子对接的作用过程、应用场景、分类,简要总结了现有分子对接软件的核心内容及评估指标。此外,调研了近两年发表的3种SOTA模型(KarmaDock、DiffBindFR、RosettaVS),对其具体细节、性能精度、应用领域等进行了分析说明,并总结了几点对未来工作的启示。1、背景介绍:•分子对接定义:受体和配体之间通过能量匹配、空间匹配和化学性质匹配而相互识别形成分子复合物,并预测...
网络 虚拟化
作者小头像 Splendid2025 2025-02-13 10:40:24
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2025-02-13 10:40:24
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AI4Science之分子材料成像调研洞察
分子成像在材料科学中具有重要的意义。以位形空间成像为例,通过观察材料内部分子的分布和相互作用,可以辅助科研人员揭示材料微观结构和组成,研究材料的表界面性质,探索材料的动态变化和相变过程,评估功能材料的性能,指导新材料的设计和优化。分子成像技术与大数据和AI的结合可以更深入地理解材料的本质特性,为解决能源、环境等领域的关键问题提供新的思路和解决方案。相比传统的深度学习任务,分子材料成像任务庞大...
机器学习
作者小头像 Splendid2025 2025-02-11 12:27:04
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DGL(0.8.x) 技术点分析
DGL为Amazon发布的图神经网络开源库(github)。支持tensorflow, pytorch, mxnet。如何初始化一个图:节点ID从0开始标号G = dgl.graph((us, vs))一系列点和边,us->vsadd_nodes(n)添加n个点add_edge(u, v)添加边u->vadd_edges(u[s], v[s])添加边u[s]->v[s]节点和边都可以具有特征...
人工智能
作者小头像 Splendid2025 2025-02-10 11:25:19
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图机器学习调研洞察:PyG与DGL
​图神经网络(Graph Neural Networks,GNN)是人工智能领域最火热的课题之一,近年来,越来越多的研究机构和企业投入大量精力研究图神经网络,推出了自己的图学习引擎,并将其广泛应用在社交网络、电商推荐、欺诈检测、知识图谱等领域。目前,主流的开源图学习引擎有DGL,PyG,GraphScope,Angel,PGL等,其基本信息如下:可以看出,DGL和PyG支持的算法数量最多,且...
Python 昇腾 机器学习
作者小头像 Splendid2025 2025-02-07 19:37:01
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新手入门:DGL在昇腾上的安装问题
首先需要确定下自己的硬件,在terminal中输入指令uname -a返回结果aarch64接着判断当前环境的python版本,在terminal中输入指令python --version返回结果Python 3.10.14可以判断需要安装aarch64的版本,如果使用whl包安装dgl,以该链接(data.dgl.ai/wheels/cu118/repo.html)为例,需要安装指定Pyt...
Python 昇腾
作者小头像 Splendid2025 2025-01-26 11:16:47
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2025-01-26 11:16:47
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