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Sentieon | 泛基因组分析流程详解
在传统的基因组学中,我们习惯于将一个“参考基因组”视为一个物种的遗传“标准答案”。然而,这就像仅凭一张标准户型图去理解所有家庭的房屋户型,必然会遗漏大量个性化的细节。泛基因组(Pan-genome)的提出,彻底打破了这一局限,为我们描绘了一幅更为宏大、精准且动态的物种遗传图谱。 泛基因组基本信息 一、泛基因组核心概念泛基因组:指的是一个物种所有个体中全部基因的集合。它不再依赖于单个参考基因...
专业服务 基因测序 数据分析
作者小头像 湾联科技 2025-10-30 10:52:01
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毅硕HPC | Pritunl + ECS + Frp 搭建远程办公VPN
本教程将介绍一种 “鱼与熊掌兼得” 的创新方案:核心VPN服务(Pritunl)部署在您本地的强大工作站上,通过轻量级的FRP内网穿透工具,借助阿里云ECS提供的稳定公网入口,安全地将其服务能力发布到互联网。 这样,远程员工只需连接到一个统一的云上地址,即可直接接入您办公室或实验室的本地网络,访问其中的设备,实现真正意义上的“远程局域网”体验。
专业服务 虚拟专用网络 VPN 高性能计算
作者小头像 湾联科技 2025-11-24 17:36:07
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Sentieon | 泛基因组相比传统变异检测的优势
泛基因组相比于传统变异检测,能够突破“单一参考”的局限,即从个体代表性到群体包容性;显著提升变异检出的能力与准确性;推动了精准医学与人群特异性的研究。
专业服务 基因测序 数据分析
作者小头像 湾联科技 2025-11-24 16:11:23
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毅硕HPC | 配置SLURM作业队列优先级
本文介绍在Slurm系统环境下,当出现作业提交或作业状态变化时,如何通过恰当的队列配置策略来实现尽可能多的任务调度处理,以达到最佳性能。
专业服务 任务调度 高性能计算
作者小头像 湾联科技 2025-11-18 11:34:31
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毅硕HPC | Rocky Linux 9 SLURM软件编译安装
Slurm 是现代HPC集群不可或缺的核心中间件。通过本教程,您将学习如何在 Rocky Linux 9 系统上从源码编译并安装配置这一强大的调度系统,为构建您自己的高性能计算环境奠定坚实的基础。
专业服务 高性能计算
作者小头像 湾联科技 2025-11-06 10:31:05
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毅硕HPC | HPC环境下的LDAP配置
在HPC环境下,LDAP是构建统一、可扩展、易维护的用户身份管理体系的基石。它将分散在各处的用户信息整合到一个逻辑中心,使得庞大的集群在用户管理上像一个单一的、连贯的系统一样工作。
专业服务 高性能计算
作者小头像 湾联科技 2025-10-27 16:17:13
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Sentieon | 小麦全基因组(WGS)分析流程
引言今天给大家介绍的是基于 Sentieon 软件开发的用于小麦全基因组测序数据的自动化流程脚本。该流程实现了从原始测序数据(FASTQ)到变异检测结果(GVCF)以及joint calling的完整分析流程,支持多个测序平台和输出格式。脚本支持原始测序数据(raw_fastq)、过滤后的测序数据(clean_fastq),进行质控、比对、排序、标记重复、生成质量评估指标,最终通过Hapl...
专业服务 基因测序 数据分析 软件开发
作者小头像 湾联科技 2025-09-25 10:18:26
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Sentieon项目文章 | 泛基因组揭示小麦结构变异与栖息地及育种的关联
普通小麦约3500-4000年前传入中国,逐渐成为华北主要农作物。 多样化的生态类型和复杂的饮食文化需求,共同驱动了中国小麦遗传多样性的形成与演变。 研究团队选取17个具有代表性的品种进行基因组测序,结合现有的泛基因组资源,识别出大量结构变异。
专业服务 基因测序 数据分析
作者小头像 湾联科技 2025-09-04 13:54:01
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Sentieon 项目文章 | 一例中国男童及139例Pearson综合征患者的临床和遗传特征
皮尔逊综合征(PS)是由线粒体DNA缺失引起的罕见多系统遗传病,主要影响骨髓和胰腺功能。该病通常在婴儿早期发病,以难治性贫血为主要表现,并逐渐累及多个器官系统。 研究团队对一例中国男童PS病例进行了临床特征分析和基因检测,通过线粒体全基因组测序和全外显子测序明确患者的遗传学病因,并分析了突变与临床表型的关联。通过文献检索收集139例PS病例资料,系统总结了该疾病的临床表现谱系和遗传特征。
专业服务 基因测序 数据分析
作者小头像 湾联科技 2025-08-14 14:18:10
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Sentieon 项目文章 | 偏远社区原住民澳大利亚人的血型基因组图谱
提维岛民由于遗传隔离形成了独特的血型抗原分布特征,与澳大利亚主要献血群体存在显著差异,在输血过程中容易引发同种免疫反应。面临着因血型抗原多态性导致的输血风险。 为解决这一问题,首次采用基于全基因组测序的RBCeq算法,对457例提维岛民样本进行了系统性血型分析。
专业服务 基因测序 数据分析 软件开发
作者小头像 湾联科技 2025-08-06 16:37:51
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