睡眠健康数据分析
项目背景
本数据集涵盖了与睡眠和日常习惯有关的诸多变量。如性别、年龄、职业、睡眠时间、睡眠质量、身体活动水平、压力水平、BMI类别、血压、心率、每日步数、以及是否有睡眠障碍等细节。
数据集的主要特征: 综合睡眠指标:
探索睡眠持续时间、质量和影响睡眠模式的因素。
生活方式因素:分析身体活动水平、压力水平和 BMI 类别。
心血管健康:检查血压和心率测量值。
睡眠障碍分析:确定失眠和睡眠呼吸暂停等睡眠障碍的发生。
数据集列:人员 ID:
每个人的标识符。
性别:人员的性别(男性/女性)。
年龄:人员的年龄(以年为单位)。
职业:人的职业或职业。
睡眠持续时间(小时):该人每天睡眠的小时数。
睡眠质量(量表:1-10):对睡眠质量的主观评分,范围从1到10。
身体活动水平(分钟/天):该人每天进行身体活动的分钟数。
压力水平(等级:1-10):对人所经历的压力水平的主观评级,范围从1到10。
BMI 类别:人的 BMI 类别(例如,体重不足、正常、超重)。
血压(收缩压/舒张压):人的血压测量值,表示收缩压超过舒张压。
心率 (bpm):人的静息心率(以每分钟心跳数为单位)。
每日步数:此人每天的步数。
睡眠障碍:人体内是否存在睡眠障碍(无、失眠、睡眠呼吸暂停)。
有关睡眠障碍专栏的详细信息:
类型 | 说明 |
---|---|
无 | 个体没有表现出任何特定的睡眠障碍。 |
失眠 | 个人难以入睡或保持睡眠状态,导致睡眠不足或质量差。 |
睡眠呼吸暂停 | 个人在睡眠期间呼吸暂停,导致睡眠模式中断和潜在的健康风险。 |
睡眠健康和生活方式数据集包括400行和13列,涵盖了与睡眠和日常习惯相关的广泛变量。它包括性别、年龄、职业、睡眠持续时间、睡眠质量、身体活动水平、压力水平、身体质量指数分类、血压、心率、每日步数以及是否存在睡眠障碍等详细信息。
在这里,我们将使用已经可供使用的“Sleep _ health _ and _ life style _ dataset . CSV”数据库,下面您将看到数据的分析、数据的处理以及使用机器模型的学习分类来实现我们的目标。
import pandas as pd
import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt
import seaborn as sns
import plotly.express as px
from sklearn.metrics import accuracy_score, confusion_matrix, classification_report
from yellowbrick.classifier import ConfusionMatrix
from sklearn.tree import DecisionTreeClassifier
from sklearn.metrics import r2_score
from sklearn.metrics import mean_absolute_error, mean_squared_error
from sklearn.model_selection import GridSearchCV
from sklearn.model_selection import RandomizedSearchCV
from sklearn.preprocessing import LabelEncoder
df = pd.read_csv('/kaggle/input/sleep-health-and-lifestyle-dataset/Sleep_health_and_lifestyle_dataset.csv', sep = ',')
这里我们可以看到,我们有分类和连续变量,我们也可以看到,我们没有空值。
- Person ID(个人ID):每个人的标识符。
- Gender(性别):人的性别(男/女)。
- Age(年龄):以年为单位的人的年龄。
- Occupation(职业):人的职业或专业。
- Sleep Duration (hours)(睡眠持续时间(小时)):人每天睡眠的小时数。
- Quality of Sleep (scale: 1-10)(睡眠质量(等级:1-10):对睡眠质量的主观评价,范围从1到10。
- Physical Activity Level (minutes/day)(身体活动水平(分钟/天)):个人每天从事身体活动的分钟数。
- Stress Level (scale: 1-10)(压力水平(等级:1-10)):对人所经历的压力水平的主观评级,范围从1到10。
- BMI Category(身体质量指数类别):个人的身体质量指数类别(例如,体重不足、正常、超重)。
- Blood Pressure (systolic/diastolic)(血压(收缩压/舒张压)):个人的血压测量值,表示为收缩压/舒张压。
- Heart Rate (bpm)(心率(bpm)):人的静息心率,单位为每分钟心跳数。
- Daily Steps(每日步数):此人每天走的步数。
- Sleep Disorder(睡眠障碍):人是否存在睡眠障碍(无、失眠、睡眠呼吸暂停)。
corr = df.corr().round(2)
plt.figure(figsize = (25,20))
sns.heatmap(corr, annot = True, cmap = 'YlOrBr')
分类变量。
在这里,当我们查看分类变量时,我们可以看到我们的数据在男性和女性之间分布良好,查看身体质量指数,我们可以看到大多数人在正常和超重之间,当我们查看我们的目标变量时,我们可以看到大多数人没有睡眠问题,那些有睡眠问题的人在失眠和睡眠呼吸暂停之间分布良好。
plt.figure(figsize = (20, 10))
plt.subplot(2, 2, 1)
plt.gca().set_title('Variable Gender')
sns.countplot(x = 'Gender', palette = 'Set2', data = df)
plt.subplot(2, 2, 2)
plt.gca().set_title('Variable BMI Category')
sns.countplot(x = 'BMI Category', palette = 'Set2', data = df)
plt.subplot(2, 2, 3)
plt.gca().set_title('Variable Sleep Disorder')
sns.countplot(x = 'Sleep Disorder', palette = 'Set2', data = df)
看看职业一栏,我们可以看到我们有一些优势职业。
连续变量。
当我们看我们的分类变量时,我们可以看到,我们在大多数变量中没有一个模式,几乎所有的变量在一些数据中显示平衡,而在另一些数据中不显示平衡。
plt.figure(figsize = (15, 18))
plt.subplot(4, 2, 1)
sns.histplot(x = df['Age'], kde = False)
plt.subplot(4, 2, 2)
sns.histplot(x = df['Sleep Duration'], kde = False)
plt.subplot(4, 2, 3)
sns.histplot(x = df['Quality of Sleep'], kde = False)
plt.subplot(4, 2, 4)
sns.histplot(x = df['Physical Activity Level'], kde = False)
plt.subplot(4, 2, 5)
sns.histplot(x = df['Stress Level'], kde = False)
plt.subplot(4, 2, 6)
sns.histplot(x = df['Heart Rate'], kde = False)
plt.subplot(4, 2, 7)
sns.histplot(x = df['Daily Steps'], kde = False)
查看箱线图,我们可以确认我们没有需要处理的异常值
plt.title("Boxplot Age", fontdict = {'fontsize': 20})
sns.boxplot(x=df["Age"])
plt.title("Boxplot Sleep Duration", fontdict = {'fontsize': 20})
sns.boxplot(x=df["Sleep Duration"])
plt.title("Boxplot Quality of Sleep", fontdict = {'fontsize': 20})
sns.boxplot(x=df["Quality of Sleep"])
plt.title("Boxplot Physical Activity Level", fontdict = {'fontsize': 20})
sns.boxplot(x=df["Physical Activity Level"])
plt.title("Boxplot Stress Level", fontdict = {'fontsize': 20})
sns.boxplot(x=df["Stress Level"])
plt.title("Boxplot Heart Rate", fontdict = {'fontsize': 20})
sns.boxplot(x=df["Heart Rate"])
plt.title("Boxplot Daily Steps", fontdict = {'fontsize': 20})
sns.boxplot(x=df["Daily Steps"])
双变量分析。
当我们比较我们的目标变量和分类变量时,我们可以看到有趣的模式,例如女性比男性有更多的睡眠问题,同样的,当我们看身体质量指数变量时,超重的人更有可能有睡眠问题,正常体重的人通常没有任何问题。
当我们看病人的职业时,我们可以看到一个非常有趣的事情,教授,护士和售货员更有可能有睡眠问题,当我们看律师,医生和工程师时,我们可以看到他们一般没有任何问题。
plt.figure(figsize = (20, 10))
plt.suptitle("Analysis Of Variable Sleep Disorder",fontweight="bold", fontsize=20)
plt.subplot(2, 1, 1)
plt.gca().set_title('Variable Gender')
sns.countplot(x = 'Gender', hue = 'Sleep Disorder', palette = 'Set2', data = df)
plt.subplot(2, 1, 2)
plt.gca().set_title('Variable BMI Category')
sns.countplot(x = 'BMI Category', hue = 'Sleep Disorder', palette = 'Set2', data = df)
plt.figure(figsize = (20, 10))
plt.subplot(2, 1, 1)
plt.gca().set_title('Variable Occupation')
sns.countplot(x = 'Occupation', hue = 'Sleep Disorder', palette = 'Set2', data = df)
plt.subplot(2, 1, 2)
plt.gca().set_title('Variable Blood Pressure')
sns.countplot(x = 'Blood Pressure', hue = 'Sleep Disorder', palette = 'Set2', data = df)
plt.figure(figsize = (25, 20))
plt.suptitle("Analysis Of Variable Sleep Disorder",fontweight="bold", fontsize=20)
plt.subplot(4,2,1)
sns.boxplot(x="Sleep Disorder", y="Age", data=df)
plt.subplot(4,2,2)
sns.boxplot(x="Sleep Disorder", y="Sleep Duration", data=df)
plt.subplot(4,2,3)
sns.boxplot(x="Sleep Disorder", y="Quality of Sleep", data=df)
plt.subplot(4,2,4)
sns.boxplot(x="Sleep Disorder", y="Physical Activity Level", data=df)
plt.subplot(4,2,5)
sns.boxplot(x="Sleep Disorder", y="Stress Level", data=df)
plt.subplot(4,2,6)
sns.boxplot(x="Sleep Disorder", y="Heart Rate", data=df)
plt.subplot(4,2,7)
sns.boxplot(x="Sleep Disorder", y="Daily Steps", data=df)
这里,我们将删除不会在模型中使用的Person ID变量。
df = df.drop('Person ID', axis = 1)
hot = pd.get_dummies(df[['Gender', 'Occupation', 'BMI Category', 'Blood Pressure']])
df = pd.concat([df, hot], axis = 1)
df = df.drop(['Gender', 'Occupation', 'BMI Category', 'Blood Pressure'], axis = 1)
X = df.drop('Sleep Disorder', axis = 1)
X = X.values
y = df['Sleep Disorder']
标准缩放器
在这里,我们将使用StandardScaler将我们的数据放在相同的比例中
from sklearn.preprocessing import StandardScaler
scaler = StandardScaler()
X_standard = scaler.fit_transform(X)
将数据转换为训练e测试,这里我们将使用30%的数据来测试机器学习模型。
from sklearn.model_selection import train_test_split
X_train,X_test, y_train, y_test = train_test_split(X_standard, y, test_size = 0.3, random_state = 0)
朴素贝叶斯
运行高斯模型。
这里我们将使用朴素贝叶斯模型,我们将使用我们的正态数据测试高斯模型。
在我们的第一个模型中,我们有一个非常差的结果,只有53%的准确率,虽然它只能很好地预测有问题的人,但它在预测没有问题的人时结果很差。
from sklearn.naive_bayes import GaussianNB
naive_bayes = GaussianNB()
naive_bayes.fit(X_train, y_train)
previsoes = naive_bayes.predict(X_test)
cm = ConfusionMatrix(naive_bayes)
cm.fit(X_train, y_train)
cm.score(X_test, y_test)
score_naive_gaussian = 0.530973451327433
决策图表
这里我们将使用决策树模型,我们将测试熵和基尼系数的计算。
在这里,我们应用GridSearch来检查哪些是可以使用的最佳指标。
parameters = {'max_depth': [3, 4, 5, 6, 7, 9, 11],
'min_samples_split': [2, 3, 4, 5, 6, 7],
'criterion': ['entropy', 'gini']
}
model = DecisionTreeClassifier()
gridDecisionTree = RandomizedSearchCV(model, parameters, cv = 3, n_jobs = -1)
gridDecisionTree.fit(X_train, y_train)
print('Mín Split: ', gridDecisionTree.best_estimator_.min_samples_split)
print('Max Nvl: ', gridDecisionTree.best_estimator_.max_depth)
print('Algorithm: ', gridDecisionTree.best_estimator_.criterion)
print('Score: ', gridDecisionTree.best_score_)
运行决策树。
现在,在我们的决策树模型中,与朴素贝叶斯相比,我们有了非常大的改进,我们有89.38%的准确性,该模型能够很好地预测3个类别。
score_tree = 0.8938053097345132
columns = df.drop('Sleep Disorder', axis = 1).columns
feature_imp = pd.Series(decision_tree.feature_importances_, index = columns).sort_values(ascending = False)
feature_imp
BMI Category_Normal 0.450011
Physical Activity Level 0.227875
Age 0.109282
BMI Category_Normal Weight 0.090082
Sleep Duration 0.041911
Stress Level 0.038346
Blood Pressure_142/92 0.017656
Occupation_Teacher 0.013466
Occupation_Lawyer 0.005720
Occupation_Engineer 0.002862
Quality of Sleep 0.002789
Gender_Female 0.000000
Blood Pressure_130/85 0.000000
Blood Pressure_122/80 0.000000
Blood Pressure_125/80 0.000000
Blood Pressure_125/82 0.000000
Blood Pressure_126/83 0.000000
Blood Pressure_128/84 0.000000
Blood Pressure_128/85 0.000000
Blood Pressure_129/84 0.000000
Blood Pressure_130/86 0.000000
Blood Pressure_120/80 0.000000
Blood Pressure_131/86 0.000000
Blood Pressure_132/87 0.000000
Blood Pressure_135/88 0.000000
Blood Pressure_135/90 0.000000
Blood Pressure_139/91 0.000000
Blood Pressure_140/90 0.000000
Blood Pressure_140/95 0.000000
Blood Pressure_121/79 0.000000
Blood Pressure_118/76 0.000000
Blood Pressure_119/77 0.000000
Gender_Male 0.000000
Occupation_Accountant 0.000000
Occupation_Doctor 0.000000
Occupation_Manager 0.000000
Occupation_Nurse 0.000000
Occupation_Sales Representative 0.000000
Occupation_Salesperson 0.000000
Occupation_Scientist 0.000000
Occupation_Software Engineer 0.000000
Daily Steps 0.000000
Heart Rate 0.000000
BMI Category_Obese 0.000000
BMI Category_Overweight 0.000000
Blood Pressure_115/78 0.000000
Blood Pressure_117/76 0.000000
Blood Pressure_118/75 0.000000
Blood Pressure_115/75 0.000000
dtype: float64
随机森林
这里我们将使用随机森林模型,我们将测试熵和基尼系数的计算。
应用网格搜索
from sklearn.ensemble import RandomForestClassifier
parameters = {'max_depth': [3, 4, 5, 6, 7, 9, 11],
'min_samples_split': [2, 3, 4, 5, 6, 7],
'criterion': ['entropy', 'gini']
}
model = RandomForestClassifier()
gridRandomForest = RandomizedSearchCV(model, parameters, cv = 5, n_jobs = -1)
gridRandomForest.fit(X_train, y_train)
print('Algorithm: ', gridRandomForest.best_estimator_.criterion)
print('Score: ', gridRandomForest.best_score_)
print('Mín Split: ', gridRandomForest.best_estimator_.min_samples_split)
print('Max Nvl: ', gridRandomForest.best_estimator_.max_depth)
运行随机森林。
在这里,在随机森林模型中,我们设法提高了更多,我们获得了90.26%的准确性。
random_forest = RandomForestClassifier(n_estimators = 100, min_samples_split = 5, max_depth= 5, criterion = 'gini', random_state = 0)
random_forest.fit(X_train, y_train)
previsoes = random_forest.predict(X_test)
cm = ConfusionMatrix(random_forest)
cm.fit(X_train, y_train)
cm.score(X_test, y_test)
score_random = 0.9026548672566371
检查模型中最重要的变量
feature_imp_random = pd.Series(random_forest.feature_importances_, index = columns).sort_values(ascending = False)
feature_imp_random
MI Category_Normal 0.131351
BMI Category_Overweight 0.130821
Blood Pressure_140/95 0.092496
Age 0.086894
Sleep Duration 0.073755
Occupation_Nurse 0.060407
Physical Activity Level 0.055393
Heart Rate 0.049097
Daily Steps 0.048757
Stress Level 0.041599
Quality of Sleep 0.030586
Occupation_Salesperson 0.026217
Blood Pressure_135/90 0.025475
Blood Pressure_130/85 0.020394
Gender_Male 0.015391
Blood Pressure_125/80 0.014591
Occupation_Doctor 0.013854
Occupation_Engineer 0.012983
Occupation_Teacher 0.012427
Gender_Female 0.011748
BMI Category_Normal Weight 0.008467
BMI Category_Obese 0.006766
Blood Pressure_120/80 0.005265
Occupation_Accountant 0.003363
Occupation_Lawyer 0.002648
Blood Pressure_132/87 0.002587
Occupation_Sales Representative 0.002245
Blood Pressure_130/86 0.001697
Blood Pressure_128/85 0.001614
Blood Pressure_128/84 0.001585
Blood Pressure_142/92 0.001332
Blood Pressure_131/86 0.001149
Blood Pressure_139/91 0.000985
Blood Pressure_129/84 0.000805
Blood Pressure_140/90 0.000802
Blood Pressure_135/88 0.000744
Blood Pressure_126/83 0.000704
Blood Pressure_118/75 0.000622
Occupation_Software Engineer 0.000531
Blood Pressure_115/75 0.000520
Occupation_Scientist 0.000515
Blood Pressure_121/79 0.000504
Blood Pressure_117/76 0.000260
Blood Pressure_115/78 0.000051
Blood Pressure_119/77 0.000001
Blood Pressure_122/80 0.000000
Blood Pressure_118/76 0.000000
Blood Pressure_125/82 0.000000
Occupation_Manager 0.000000
dtype: float64
额外的树
这里我们将使用额外的树模型,我们将测试熵和基尼系数的计算。
应用网格搜索
from sklearn.ensemble import ExtraTreesClassifier
parameters = {'max_depth': [3, 4, 5, 6, 7, 9, 11],
'min_samples_split': [2, 3, 4, 5, 6, 7],
'criterion': ['entropy', 'gini']
}
model = ExtraTreesClassifier()
gridExtraTrees = RandomizedSearchCV(model, parameters, cv = 3, n_jobs = -1)
gridExtraTrees.fit(X_train, y_train)
print('Algorithm: ', gridExtraTrees.best_estimator_.criterion)
print('Score: ', gridExtraTrees.best_score_)
print('Mín Split: ', gridExtraTrees.best_estimator_.min_samples_split)
print('Max Nvl: ', gridExtraTrees.best_estimator_.max_depth)
score_extra = 0.8849557522123894
kNN
这里我们将使用K-Neighbors模型,我们将使用GridSearch模型来找出在该模型中使用的最佳指标。
在这里,我们将使用GridSearch来找出在该模型中使用的最佳指标。
from sklearn.neighbors import KNeighborsClassifier
knn = KNeighborsClassifier()
k_list = list(range(1,10))
k_values = dict(n_neighbors = k_list)
grid = GridSearchCV(knn, k_values, cv = 2, scoring = 'accuracy', n_jobs = -1)
grid.fit(X_train, y_train)
grid.best_params_, grid.best_score_
运行K-Neighbors。
虽然我们的结果稍差,但它仍然是一个很好的模型,准确率为88.49%。
knn = KNeighborsClassifier(n_neighbors = 5, metric = 'minkowski', p = 2)
knn.fit(X_train, y_train)
previsoes = knn.predict(X_test)
cm = ConfusionMatrix(knn)
cm.fit(X_train, y_train)
cm.score(X_test, y_test)
score_knn = 0.8849557522123894
逻辑回归
这里我们将使用线性回归模型。
我们设法得到了一个更好的结果,在逻辑回归模型中,我们有91.11%的准确率。
from sklearn.linear_model import LogisticRegression
logistic = LogisticRegression(random_state = 1, max_iter=10000)
logistic.fit(X_train, y_train)
previsoes = logistic.predict(X_test)
cm = ConfusionMatrix(logistic)
cm.fit(X_train, y_train)
cm.score(X_test, y_test)
logistic_normal = 0.911504424778761
adaboost算法
这里我们将使用AdaBoost模型,我们将使用GridSearch模型来找出在该模型中使用的最佳指标。
应用网格搜索
from sklearn.ensemble import AdaBoostClassifier
parameters = {'learning_rate': [0.01, 0.02, 0.05, 0.07, 0.09, 0.1, 0.3, 0.001, 0.005],
'n_estimators': [300, 500]
}
model = AdaBoostClassifier()
gridAdaBoost = RandomizedSearchCV(model, parameters, cv = 2, n_jobs = -1)
gridAdaBoost.fit(X_train, y_train)
print('Learning Rate: ', gridAdaBoost.best_estimator_.learning_rate)
print('Score: ', gridAdaBoost.best_score_)
运行Ada Boost。
这里,在AdaBoost模型中,我们设法保持与模型相同的质量,准确率为91.15%。
ada_boost = AdaBoostClassifier(n_estimators = 500, learning_rate = 0.02, random_state = 0)
ada_boost.fit(X_train, y_train)
previsoes = ada_boost.predict(X_test)
cm = ConfusionMatrix(ada_boost)
cm.fit(X_train, y_train)
cm.score(X_test, y_test)
score_ada_scaler = 0.911504424778761
我们的数据不是很多,,我们的样本总共只有13列374个数据,另一件使我们的工作更容易的事情是,我们没有空值,所以我们不需要执行处理。
当进行数据分析时,我们可以看到我们的数据之间有很多相关性,但由于我们几乎没有可用的数据,所以没有删除这些数据,当我们具体查看我们的分类变量时,我们可以看到我们的数据在性别变量方面很平衡, 当我们查看我们的目标变量时,我们可以看到我们的大部分数据没有睡眠问题,那些有睡眠问题的数据在两个类别之间很好地平衡(睡眠呼吸暂停和失眠),当我们查看连续变量时,我们没有发现它们之间的模式,查看箱线图时,我发现没有必要处理异常值,数据分布良好。
当我们观察双变量分析比较我们的目标变量和我们的解释数据时,我们已经得出了一些结论,女性更有可能有睡眠问题,当我们看身体质量指数变量时,我们可以看到正常体重的人通常没有问题,超重的人通常更有可能有睡眠问题。 当我们看可变职业时,有趣的是看到一些职业比其他职业更容易有睡眠问题,另一个引起我注意的变量是年龄变量,老年人更容易有睡眠问题。
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