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GEE：全球土壤线虫的丰度和功能组的组成数据集

此星光明发表于 2023/02/10 18:25:11 2023/02/10

【摘要】土壤线虫的丰度和功能组的组成Soil nematode abundance & functional group composition作为地球上最丰富的动物，线虫是土壤群落的一个主要组成部分。它们在调节生物地球化学循环和植被动态方面发挥着关键作用，是土壤生物活动的一个指标。在这里，我们提出了一个全面的土壤线虫丰度和功能组组成的全球数据集。该数据集包括来自各大洲和生物群落的6825个地理...

土壤线虫的丰度和功能组的组成

Soil nematode abundance & functional group composition
作为地球上最丰富的动物，线虫是土壤群落的一个主要组成部分。它们在调节生物地球化学循环和植被动态方面发挥着关键作用，是土壤生物活动的一个指标。在这里，我们提出了一个全面的土壤线虫丰度和功能组组成的全球数据集。该数据集包括来自各大洲和生物群落的6825个地理坐标的土壤样本。出于地理空间绘图的目的，这些样本被汇总成1933个独特的1公里像素，每个像素都与73个全球环境协变量数据层相联系。这项研究使用了来自世界各地6825个地理坐标点的土壤线虫丰度的直接测量，涵盖了所有大陆和所有陆地生物群落。您可以在这里阅读该论文：

数据引用：

Hoogen, Johan van den; Geisen, Stefan; Wall, Diana H.; Wardle, David A.; Traunspurger, Walter; Goede, Ron G. M. de;et al. (2020): A global database of soil nematode abundance and functional group composition. figshare. Collection.https://doi.org/10.6084/m9.figshare.c.4718003.v1

文章引用：

van den Hoogen, J., Geisen, S., Wall, D.H. et al. A global database of soil nematode abundance and functional group composition. Sci Data 7, 103 (2020). https://doi.org/10.1038/s41597-020-0437-3

编辑

代码链接：https://code.earthengine.google.com/?scriptPath=users/sat-io/awesome-gee-catalog-examples:geophysical-biological-biogeochemical/SOIL-NEMATODE-ABUNDANCE

代码：

var nematode = ee.FeatureCollection("projects/sat-io/open-datasets/global-nematode");

Map.addLayer(nematode)
print(nematode.size())

数据列表：

Property Name	GEE_Property	Description	Units	Source
Sample_ID	Sample_ID	Unique sample ID
Bacterivores	Bacterivores	Number of bacterivorous nematodes	individuals per 100g dry soil
Fungivores	Fungivores	Number of fungivorous nematodes	individuals per 100g dry soil
Herbivores	Herbivores	Number of herbivorous nematodes	individuals per 100g dry soil
Omnivores	Omnivores	Number of omnivorous nematodes	individuals per 100g dry soil
Predators	Predators	Number of predatory nematodes	individuals per 100g dry soil
Unidentified	Unidentified	Number of unidentified nematodes	individuals per 100g dry soil
Total_Number	Total_Number	Total number of nematodes	individuals per 100g dry soil
Latitude	Pixel_Lat	Sample latitude	Decimal degree in WGS84
Longitude	Pixel_Long	Sample longitude	Decimal degree in WGS84
WWF_Biome	WWF_Biome	WWF Biome		Biomes \| Conserving Biomes \| WWF
sampling method	sampling method:	Nematode extraction method
sampling_ref	sampling_ref	Nematode extraction method, summarised
sampling depth	sampling depth	Sampling Depth	cm
DOI/URL	DOI/URL	Reference to original publication, where applicable
Data_provider	Data_provider	Name of co-author(s) who supplied data