问题

在线动态设置long_query_time，从10秒设置到了1秒，执行慢sql，没有记录到慢查询日志中。

解决方案

查看慢查询日志是否有开启

show variables like '%slow_query_log%'; 
show variables like '%long_query_time%'; 

是已经开启的。如果没有开启，请按上文介绍的方式操作，这里不再赘述。
慢查询阀值是10s,改为1s.

SET GLOBAL long_query_time = 1;

修改之后，建议重新开一个会话查询（旧会话查询出的值可能是原来的10s）

扩展

其它可能失效的原因

慢查询日志失效原因二：未使用索引的 SQL 记录不会写入慢查询日志

查看设置，默认是关闭的。

show variables like 'log_queries_not_using_indexes';

查看慢查询日志是否有开启

show variables like '%slow_query_log%'; 
show variables like '%long_query_time%'; 

是已经开启的。如果没有开启，请按上文介绍的方式操作，这里不再赘述。

测试sql
检查student 表的索引：

show index from student;

执行没有使用索引的sql:

select *
from student
where student_name ='student_name446741'

慢查询日志中，并没有记录到。

使用索引的 SQL 记录写入慢查询日志：

set global log_queries_not_using_indexes=on;

再执行慢查询的sql

select *
from student
where student_name ='student_name446741'

没有索引的数据也添加到慢查询日志了。

注：log_queries_not_using_indexes参数要跟参数log_throttle_queries_not_using_indexes配合使用

log_throttle_queries_not_using_indexes：该参数决定每分钟记录未使用索引的SQL的数量上限，因为未使用索引的SQL可能会非常多，导致慢日志空间增长飞快。

慢查询日志失效原因三：慢sql里有锁等待

慢SQL里有大量锁等待，慢SQL的执行时间不包含锁等待的时间

慢查询日志失效原因四：默认不记录管理类命令的慢sql

log_slow_admin_statements=0，因此alter, create index, analyze table等操作即使超过 long_query_time，也不会记录到慢日志中。
log_slow_admin_statements 该参数决定是否记录管理类的命令，有 ALTER TABLE,ANALYZE TABLE, CHECK TABLE, CREATE INDEX, DROP INDEX, OPTIMIZE TABLE,REPAIR TABLE，默认是不记录这一类语句到慢日志。

慢查询日志失效原因五：min_examined_row_limit为非0

min_examined_row_limit 该参数定义一个SQL所读取的数据行数；
min_examined_row_limit设置为非0值，SQL检查行数未超过该值，也不会记录。
默认值为0

慢查询日志失效原因六：slow log文件句柄发生了变化

slow log文件钻句柄发生了变化，如运行期间用vim打开log，最后又保存退出，此时文件句柄发生变化，需要执行flush slow logs。

慢查询日志失效原因七：从库的复制语句默认不记录

log_slow_slave_statements：该参数在从库上设置，决定是否记录在复制过程中超过long_query_time的SQL，如果binlog格式是row，则即使开启了该参数，也不会记录相关SQL。
除非binlog格式是statement且开启log_slow_slave_statements。

参考

SQL进阶-查询优化-慢查询日志（SQL 小虚竹)