【数据可视化应用】R语言绘制树地图（附代码）

安装R包

TreeAndLeaf需要R 4.01并通过BiocManager进行安装，需要版本为 3.14

  

   

    

     

    
    

     

      if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE))
     
    
   

    

     

    
    

     

        install.packages("BiocManager")
     
    
   

    

     

    
    

     

      BiocManager::install(version = "3.14")
     
    
   

    

     

    
    

     
 
     
    
   

    

     

    
    

     

      BiocManager::install("TreeAndLeaf")
     
    
   

    

     

    
    

     

      BiocManager::install("geneplast")
     
    
  
 

加载R包

  

   

    

     

    
    

     

      library(TreeAndLeaf)
     
    
   

    

     

    
    

     

      library(tidyverse)
     
    
   

    

     

    
    

     

      library(RedeR)
     
    
   

    

     

    
    

     

      library(igraph)
     
    
   

    

     

    
    

     

      library(RColorBrewer)
     
    
   

    

     

    
    

     

    
  
 

构建聚类树

使用USArrests数据集合来构建树状图，通过dist()函数来计算距离矩阵

hc <- hclust(dist(USArrests), "ave")

 

将hclust对象转化为树和叶

使用treeAndLeaf函数将hclust转换为igraph对象

tal <- treeAndLeaf(hc)

 

设置图像属性

• 将数据映射到树和叶

• refcol=0 表示用数据行名作为ID

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