RDKit | 基于RDKit探索化学空间-smiles悬停
【摘要】
环境
Win10
RDKit2021.09.2
Python=3.7
基于RDKit探索化学空间-smiles悬停
导入库
import sysimport osimport pandas as pdimport numpy as npimport altair as alt from rdkit import...
环境
- Win10
- RDKit2021.09.2
- Python=3.7
基于RDKit探索化学空间-smiles悬停
导入库
import sys
import os
import pandas as pd
import numpy as np
import altair as alt
from rdkit import Chem
from rdkit import rdBase
from rdkit.Chem import AllChem
from rdkit.Chem import DataStructs
from rdkit.Chem import PandasTools
from rdkit.Chem import RDConfig
from rdkit.Chem import Draw
from rdkit.Chem.Draw import IPythonConsole
from sklearn.decomposition import PCA
print(rdBase.rdkitVersion)
载入数据
ROMol对象转换为smiles
df = PandasTools.LoadSDF('cdk2.sdf')
df['SMILES&#
文章来源: drugai.blog.csdn.net,作者:DrugAI,版权归原作者所有,如需转载,请联系作者。
原文链接:drugai.blog.csdn.net/article/details/122900013
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