RDKit | 基于RDKit探索化学空间-smiles悬停

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DrugAI 发表于 2022/02/12 22:55:39 2022/02/12
【摘要】 环境 Win10 RDKit2021.09.2 Python=3.7 基于RDKit探索化学空间-smiles悬停 导入库 import sysimport osimport pandas as pdimport numpy as npimport altair as alt from rdkit import...

环境

  • Win10
  • RDKit2021.09.2
  • Python=3.7

基于RDKit探索化学空间-smiles悬停

导入库


      import sys
      import os
      import pandas as pd
      import numpy as np
      import altair as alt
      from rdkit import Chem
      from rdkit import rdBase
      from rdkit.Chem import AllChem
      from rdkit.Chem import DataStructs
      from rdkit.Chem import PandasTools
      from rdkit.Chem import RDConfig
      from rdkit.Chem import Draw
      from rdkit.Chem.Draw import IPythonConsole
      from sklearn.decomposition import PCA
      print(rdBase.rdkitVersion)
  
 

载入数据

ROMol对象转换为smiles


      df = PandasTools.LoadSDF('cdk2.sdf')
      df['SMILES&#
  
 

文章来源: drugai.blog.csdn.net,作者:DrugAI,版权归原作者所有,如需转载,请联系作者。

原文链接:drugai.blog.csdn.net/article/details/122900013

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