初识R语言之安装调用篇

手动安装

1 通过Rstudio菜单安装

1.1 Tools--Install Pacakges...

1.2 Pacakges--Install

ggplot2

通过install.pacakges命令安装

  

   

    

     

    
    

     

      install.packages('readxl')
     
    
   

    

     

    
    

     

      install.packages('writexl')
     
    
  
 

通过BiocManager安装

手动选择镜像源

  

   

    

     

    
    

     

      install.packages('BiocManager')  # 安装一次
     
    
   

    

     

    
    

     

      options(BioC_mirror='https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/bioconductor') 
     
    
   

    

     

    
    

     

      # 每次打开Rstudio均需要设置
     
    
   

    

     

    
    

     

      BiocManager::install('DESeq2') # Update all/some/none? [a/s/n]: n
     
    
  
 

设置Rprofile.site

  

   

    

     

    
    

     

      local({
     
    
   

    

     

    
    

     

        r = getOption('repos')
     
    
   

    

     

    
    

     

        options(repos = r, BioC_mirror='https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/bioconductor')
     
    
   

    

     

    
    

     

      })
     
    
  
 

软件调用

  

   

    

     

    
    

     

      library(ggplot2)
     
    
   

    

     

    
    

     

      library(readxl)
     
    
   

    

     

    
    

     

      library(DESeq2)
     
    
  
 

每文一语

书籍是良药也是毒药

文章来源: wxw-123.blog.csdn.net，作者：王小王-123，版权归原作者所有，如需转载，请联系作者。

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