Linux(64位)下OpenBabel 2.4.1、python2.7和Ipython实战(三)

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DrugAI 发表于 2021/07/15 05:22:18 2021/07/15
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【摘要】 Python调用OpenBabel的API,输出sdf文件中分子的分子量 官网手册地址:点击打开链接 第一种方式 from pybel import * for molecule in readfile("sdf","Sofosbuvir.sdf"):     print molecule.molwt 第二种方式 from openbabe...

Python调用OpenBabel的API,输出sdf文件中分子的分子量

官网手册地址:点击打开链接

第一种方式

from pybel import *

for molecule in readfile("sdf","Sofosbuvir.sdf"):
    print molecule.molwt

第二种方式


      from openbabel import *
      obconversion = OBConversion()
      obconversion.SetInFormat("sdf")
      obmol = OBMol()
      notatend = obconversion.ReadFile(obmol,"Sofosbuvir.sdf")
      while notatend:
      print obmol.GetMolWt()
       obmol = OBMol()
       notatend = obconversion.Read(obmol)
  
 




多分子sdf文件中分子的分子量输出

实例


      from pybel import *
      for molecule in readfile("sdf","NatProduct.sdf"):
      print molecule.molwt
  
 



文章来源: drugai.blog.csdn.net,作者:DrugAI,版权归原作者所有,如需转载,请联系作者。

原文链接:drugai.blog.csdn.net/article/details/77610910

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