Linux(64位)下OpenBabel 2.4.1、python2.7和Ipython实战(二)

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DrugAI 发表于 2021/07/15 04:27:57 2021/07/15
【摘要】 OpenBabel 分割多分子sdf文件 Python调用OpenBabel的API实例,来自openbabel手册,网址点击打开链接手册 实例 import pybel for mol in pybel.readfile("sdf", "NatProduct.sdf"): mol.write("sdf", "%s.sdf" % mol.title) ...

OpenBabel 分割多分子sdf文件

Python调用OpenBabel的API实例,来自openbabel手册,网址点击打开链接手册

实例


  
  1. import pybel
  2. for mol in pybel.readfile("sdf", "NatProduct.sdf"):
  3. mol.write("sdf", "%s.sdf" % mol.title)


分割效果

含有133个分子的sdf'格式文件,分割为了133个单个分子的sdf文件。






文章来源: drugai.blog.csdn.net,作者:DrugAI,版权归原作者所有,如需转载,请联系作者。

原文链接:drugai.blog.csdn.net/article/details/77610497

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