RDKit是一款开源化学信息学与机器学习工具包，提供C++和Python的API接口。

配置好RDKit和Python2.7的环境，运行参考网站的部分代码的效果如下：

  

   

    

     

    
    

     

      #！Python2.7
     
    
   

    

     

    
    

     
 
     
    
   

    

     

    
    

     

      from rdkit.Chem import AllChem as Chem
     
    
   

    

     

    
    

     

      from rdkit.Chem.Draw import IPythonConsole
     
    
   

    

     

    
    

     

      from rdkit.Chem import Descriptors
     
    
   

    

     

    
    

     

      from rdkit import DataStructs
     
    
   

    

     

    
    

     
 
     
    
   

    

     

    
    

     

      smi = 'CCCc1nn(C)c2C(=O)NC(=Nc12)c3cc(ccc3OCC)S(=O)(=O)N4CCN(C)CC4' #sildenafil
     
    
   

    

     

    
    

     

      m = Chem.MolFromSmiles(smi)
     
    
   

    

     

    
    

     

      m
     
    
   

    

     

    
    

     
 
     
    
   

    

     

    
    

     

      smi2 = 'CCCc1nc(C)c2C(=O)N=C(Nn12)c3cc(ccc3OCC)S(=O)(=O)N4CCN(CC)
     
    
  
 

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