UCSF DOCK6.8对接教程之蛋白分子表面和受体空间准备
【摘要】 UCSF DOCK6.8对接教程
DOCK6 是UCSF (加利福尼亚大学洛杉矶分校)开发出的一套用于模拟分子对接的软件。用于学术研究目的DOCK6 官网申请,申请时需要填写真实详细的信息(学校名称、网站地址、导师名称等等)。
DOCK6.8安装
U...
UCSF DOCK6.8对接教程
DOCK6 是UCSF (加利福尼亚大学洛杉矶分校)开发出的一套用于模拟分子对接的软件。用于学术研究目的DOCK6 官网申请,申请时需要填写真实详细的信息(学校名称、网站地址、导师名称等等)。
UCSF DOCK6.8对接教程之准备受体和配体文件:点击打开链接
准备蛋白质分子的表面文件(Chimera)
打开rec_noH.pdb,Action>Surface>show
Tools>Structure Editing>Write DMS ,保存为rec.dms
生成受体空间(DOCK6.8)
将INSPH文件放入对接文件夹;
INSPH
rec.dms
R
X
0.0
4.0
1.4
rec.sph
终端输入sphgen,生成OUTSPH和rec.sph
文章来源: drugai.blog.csdn.net,作者:DrugAI,版权归原作者所有,如需转载,请联系作者。
原文链接:drugai.blog.csdn.net/article/details/78555962
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