RDKit toolkit实战三：描述符计算及可视化

Descriptor Calculation   &   Visualization of Descriptors

Linux（CentOS 7_x64位）系统下安装RDkit(修正)点击打开链接

RDKit toolkit实战演练学习一下，参考网站点击打开链接

描述符计算在结构搜索比对以及QSAR中应用很广。

  

   

    

     

    
    

     

      #!Python2.7
     
    
   

    

     

    
    

     

      from rdkit import Chem
     
    
   

    

     

    
    

     

      from rdkit.Chem import Descriptors
     
    
   

    

     

    
    

     

      from rdkit.Chem import AllChem
     
    
   

    

     

    
    

     

      from rdkit.Chem.Draw import SimilarityMaps
     
    
   

    

     

    
    

     
 
     
    
   

    

     

    
    

     

      m = Chem.MolFromSmiles('c1ccccc1C(=O)O')
     
    
   

    

     

    
    

     
 
     
    
   

    

     

    
    

     

      Descriptors.TPSA(m)
     
    
   

    

     

    
    

     
 
     
    
   

    

     

    
    

     

      m = Chem.MolFromSmiles(
     
    
  
 

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