开源化学信息学工具包(Open Access Cheminformatics Toolkits)

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DrugAI 发表于 2021/07/15 06:44:48 2021/07/15
【摘要】   1. CDK (Chemistry Development Kit)  官网:https://cdk.github.io/点击打开链接         CDK是结构化学信息学和生物信息学的开源Java库。 该项目由Christoph Steinbeck,Egon Wi...

 

1. CDK (Chemistry Development Kit) 

官网:https://cdk.github.io/点击打开链接

        CDK是结构化学信息学和生物信息学的开源Java库。 该项目由Christoph Steinbeck,Egon Willighagen与Jmol和JChemPaint的开发人员Dan Gezelter于2000年发起。迄今为止,它是在科学界广泛支持下开展的最活跃的开源化学信息学项目之一。 

        CDK工具包为开发化学信息领域的新软件提供了许多功能,例如各种化学输入/输出(I/O)文件格式,包括简化的分子输入行输入系统(SMILES),化学标记语言(CML)和麻省理工学院设计语言(MDL); 结构发生器;;2D图表编辑和生成;3D几何图形生成;使用精确结构和SMARTS类查询进行子结构搜索;定量构效关系分子描述子计算(QSAR)研究;指纹计算;国际化学标识符(InChI)支持;在生物信息学领域,功能包括同源配体检测,代谢物鉴定等。

 

2. RDKit

官网:

文章来源: drugai.blog.csdn.net,作者:DrugAI,版权归原作者所有,如需转载,请联系作者。

原文链接:drugai.blog.csdn.net/article/details/80509349

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