化学结构格式SDF的认识

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DrugAI 发表于 2021/07/15 04:55:44 2021/07/15
【摘要】   第一行:一般作为分子名字,如 Levetiracetam 第二行:注释,ChemDraw06111413562D 第三行:一般是空行 第四行:是原子个数 键的个数等的起始行。 M  END所在行结束原子个数 键的个数等信息。 属性1 属性1值 空行 属性2 属性2值 空行 (以四个美元符号结束一个分子的信息存储。) Levet...

 

第一行:一般作为分子名字,如 Levetiracetam

第二行:注释,ChemDraw06111413562D

第三行:一般是空行

第四行:是原子个数 键的个数等的起始行。

M  END所在行结束原子个数 键的个数等信息。

属性1

属性1值

空行

属性2

属性2值

空行

(以四个美元符号结束一个分子的信息存储。)


  
  1. Levetiracetam
  2. ChemDraw06111413562D
  3. 12 12 0 0 0 0 0 0 0 0999 V2000
  4. -1.4405 -0.4285 0.0000 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
  5. -0.7260 -0.8410 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
  6. -0.0116 -0.4285 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
  7. 0.7029 -0.8410 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
  8. 1.4174 -0.4285 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
  9. -0.0116 0.3965 0.0000 N 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
  10. -0.7260 -1.6660 0.0000 N 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
  11. 0.6559 0.8814 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
  12. 0.4009 1.6660 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
  13. -0.4241 1.6660 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
  14. -0.6790 0.8814 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
  15. 1.4405 0.6265 0.0000 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
  16. 1 2 2 0
  17. 2 3 1 0
  18. 3 4 1 1
  19. 4 5 1 0
  20. 3 6 1 0
  21. 2 7 1 0
  22. 6 8 1 0
  23. 8 9 1 0
  24. 9 10 1 0
  25. 10 11 1 0
  26. 11 6 1 0
  27. 8 12 2 0
  28. M END
  29. > <Catalog Number> (1)
  30. A1198
  31. > <Item Name> (1)
  32. Levetiracetam
  33. > <Formula> (1)
  34. C8H14N2O2
  35. > <MolWeight> (1)
  36. 170.21
  37. > <CAS Number> (1)
  38. 102767-28-2
  39. > <Target> (1)
  40. Cancer Biology
  41. $$$$

参考

http://blog.sciencenet.cn/home.php?mod=space&uid=950202&do=blog&quickforward=1&id=855096

 

文章来源: drugai.blog.csdn.net,作者:DrugAI,版权归原作者所有,如需转载,请联系作者。

原文链接:drugai.blog.csdn.net/article/details/82383983

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