化学结构格式SDF的认识

第一行：一般作为分子名字，如 Levetiracetam

第二行：注释，ChemDraw06111413562D

第三行：一般是空行

第四行：是原子个数 键的个数等的起始行。

M  END所在行结束原子个数 键的个数等信息。

属性1

属性1值

空行

属性2

属性2值

空行

(以四个美元符号结束一个分子的信息存储。)

      Levetiracetam
       ChemDraw06111413562D
      12 12  0  0  0  0  0  0  0  0999 V2000
        -1.4405   -0.4285 0.0000 O   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
        -0.7260   -0.8410 0.0000 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
        -0.0116   -0.4285 0.0000 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
      0.7029   -0.8410 0.0000 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
      1.4174   -0.4285 0.0000 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
        -0.0116 0.3965 0.0000 N   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
        -0.7260   -1.6660 0.0000 N   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
      0.6559 0.8814 0.0000 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
      0.4009 1.6660 0.0000 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
        -0.4241 1.6660 0.0000 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
        -0.6790 0.8814 0.0000 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
      1.4405 0.6265 0.0000 O   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
       1  2  2  0
       2  3  1  0
       3  4  1  1
       4  5  1  0
       3  6  1  0
       2  7  1  0
       6  8  1  0
       8  9  1  0
       9 10  1  0
      10 11  1  0
      11  6  1  0
       8 12  2  0
      M  END
      >  <Catalog Number> (1)
      A1198
      >  <Item Name> (1)
      Levetiracetam
      >  <Formula> (1)
      C8H14N2O2
      >  <MolWeight> (1)
      170.21
      >  <CAS Number> (1)
      102767-28-2
      >  <Target> (1)
      Cancer Biology
      $$$$
  
 

参考

http://blog.sciencenet.cn/home.php?mod=space&uid=950202&do=blog&quickforward=1&id=855096

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