Biopython:Fasta格式转CSV格式
【摘要】 Fasta格式转CSV格式
#载入数据 meta=[]sequence=[]seq = ('ls_orchid.fasta')for seq_record in SeqIO.parse(seq, "fasta"): meta.append(str(seq_record.id)) sequence.append(str(seq_record.seq))
#print(seq...
Fasta格式转CSV格式
#载入数据
meta=[]
sequence=[]
seq = ('ls_orchid.fasta')
for seq_record in SeqIO.parse(seq, "fasta"):
meta.append(str(seq_record.id))
sequence.append(str(seq_record.seq))
#print(sequence)
df= pd.DataFrame(data ={'Meta':meta,'SequenceID':sequence})
print(df)
#数据存入csv
df.to_csv("nc_data.csv", sep=',',index=False)
文章来源: drugai.blog.csdn.net,作者:DrugAI,版权归原作者所有,如需转载,请联系作者。
原文链接:drugai.blog.csdn.net/article/details/82532266
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