RDKit | 比较分子之间的相似性

                                                     比较分子之间的相似性

获取结构和数据，将SMILES转换为RDKit分子对象，然后比较相似性。

1.导入python模块

      import numpy as np
      import pandas as pd
      import seaborn as sns
      import matplotlib as plt
      from rdkit.Chem import AllChem as Chem
      from rdkit.Chem.Draw import IPythonConsole
      from rdkit.Chem import PandasTools
      from rdkit.Chem import Draw
      from rdkit import DataStructs
      %matplotlib inline
  
 

      #load data
      data = pd.read_csv('molecules.tsv', sep = '\t')
  
 

      #View first five rows
      data.head()
  
 

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