RDKit | 分子的多种构象

导入库

  

   

    

     

    
    

     

      from rdkit import Chem
     
    
   

    

     

    
    

     

      from rdkit.Chem import AllChem
     
    
   

    

     

    
    

     

      from rdkit.Chem.Draw import IPythonConsole
     
    
   

    

     

    
    

     

      from rdkit.Chem.Draw.MolDrawing import MolDrawing, DrawingOptions
     
    
   

    

     

    
    

     

      import pickle
     
    
   

    

     

    
    

     

      from rdkit.Chem import PyMol
     
    
  
 

  

   

    

     

    
    

     

      molH = pickle.load(open('molH.pkl','rb'))
     
    
   

    

     

    
    

     

      molH
     
    
  
 

  

   

    

     

    
    

     

      cids = AllChem.EmbedMultipleConfs(molH, 
     
    
   

    

     

    
    

     

       clearConfs=True, 
     
    
   

    

     

    
    

     

       numConfs=100, 
     
    
   

    

     

    
    

     

       pruneRmsThresh=1)
     
    
  
 

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