RDKit | 分子坐标的测量和绘图
【摘要】
导入库
from rdkit import Chemfrom rdkit.Chem import AllChemfrom rdkit.Chem.Draw import IPythonConsolefrom rdkit.Chem import PyMolimport pickle
molH = pickle.load(open('molH_confs.pkl...
导入库
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from rdkit import Chem
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from rdkit.Chem import AllChem
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from rdkit.Chem.Draw import IPythonConsole
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from rdkit.Chem import PyMol
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import pickle
molH = pickle.load(open('molH_confs.pkl','rb'))
confs = molH.GetConformers()
diheds = [Chem.rdMolTransforms.GetDihedralDeg(conf,1,3,4,5) for conf in confs]
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%matplotlib inline
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import matplotlib.pyplot as plt
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plt.style.use('ggplot')
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fig,ax = plt.subplots()
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n,bins,patches = ax.hist(diheds,bins=36)
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ax.set_xlabel('Dihedral Angle')
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ax.set_ylabel('Counts');
文章来源: drugai.blog.csdn.net,作者:DrugAI,版权归原作者所有,如需转载,请联系作者。
原文链接:drugai.blog.csdn.net/article/details/100833313
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