RDKit | 计算化合物描述符

描述符

Descriptor：通过量化部分结构特征和物理化学性质来表达化合物的化学特征。

导入库

  

   

    

     

    
    

     

      import rdkit
     
    
   

    

     

    
    

     

      import pandas as pd
     
    
   

    

     

    
    

     

      from rdkit import Chem
     
    
   

    

     

    
    

     

      from rdkit.Chem import Descriptors
     
    
   

    

     

    
    

     

      from rdkit.ML.Descriptors import MoleculeDescriptors
     
    
  
 

载入数据

  

   

    

     

    
    

     

      suppl = Chem.SDMolSupplier('minidatabase.sdf')
     
    
   

    

     

    
    

     

      mols = [x for x in suppl if x is not None]
     
    
  
 

定义描述符列表

descs = [desc_name[0] for desc_name in Descriptors._descList]
 

化合物数目

print(len(mols))
 

描述符数目

文章来源: drugai.blog.csdn.net，作者：DrugAI，版权归原作者所有，如需转载，请联系作者。

原文链接：drugai.blog.csdn.net/article/details/101682612