DeepChem | DeepChem的图卷积特征化器

DeepChem

官网：https://deepchem.io/

DeepChem旨在提供高质量的开源工具链，将药物开发、材料科学、量子化学和生物学方面的深度学习应用普及化。

DeepChem提供了几种用于图卷积的特征提取方法。探索对其中一种图形卷积Featurizer所做的事情。

运行环境

• CentOS 7
• Python3.6
• DeepChem2.2

导入库

  

   

    

     

    
    

     

      import os
     
    
   

    

     

    
    

     

      import pandas as pd
     
    
   

    

     

    
    

     

      import numpy as np
     
    
   

    

     

    
    

     

      from deepchem.models.tensorgraph.models.graph_models import GraphConvModel
     
    
   

    

     

    
    

     

      import deepchem.feat.graph_features
     
    
   

    

     

    
    

     

      from rdkit import Chem
     
    
   

    

     

    
    

     

      from rdkit.Chem.Draw import IPythonConsole
     
    
   

    

     

    
    

     

      from IPython.display import SVG
     
    
   

    

     

    
    

     

      from rdkit.Chem import rdDepictor
     
    
   

    

     

    
    

     

      from rdkit.Chem.Draw import rdMolDraw2D
     
    
  
 

载入数据

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