RDKit | 基于分子形状的比对
【摘要】 基于分子形状的比对对于虚拟筛选和骨架跃迁都是非常有用的。
导入库
import osfrom rdkit ...
基于分子形状的比对对于虚拟筛选和骨架跃迁都是非常有用的。
导入库
import os
from rdkit import Chem
from rdkit.Chem import AllChem
from rdkit import RDConfig
from rdkit.Chem.Draw import IPythonConsole
from rdkit.Chem import Draw
from rdkit.Chem import PyMol
from rdkit.Chem.Subshape import SubshapeBuilder, SubshapeAligner, SubshapeObjects
载入数据
mols = [ Chem.AddHs(m) for m in Chem.SDMolSupplier("cdk2.sdf")]
可视化(调用Pymol)
v = PyMol.MolViewer()
cidslist=[]
文章来源: drugai.blog.csdn.net,作者:DrugAI,版权归原作者所有,如需转载,请联系作者。
原文链接:drugai.blog.csdn.net/article/details/102603960
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