RDKit | 化合物芳香度分子描述符的计算与相关性比较

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DrugAI 发表于 2021/07/15 02:40:48 2021/07/15
【摘要】         分子描述符是确定分子性质的指标。         本文想看看描述分子特性中侧重于“ 化合物芳香度 ”的描述符。随着交叉偶联反应的发展,将芳环引入分子变得更加容易。另一方面,已知具有多个芳环的化合物的物理性质不是非常良好。因此,从数字上把握化合物的芳香度是药物发...

        分子描述符是确定分子性质的指标。

        本文想看看描述分子特性中侧重于“ 化合物芳香度 ”的描述符。随着交叉偶联反应的发展,将芳环引入分子变得更加容易。另一方面,已知具有多个芳环的化合物的物理性质不是非常良好。因此,从数字上把握化合物的芳香度是药物发现化学研究中的有用指南。

已经提出了各种描述符:

  • 表示芳香度的描述符的定义和性质
  • 如何使用RDKit计算

芳香指标:Ar / HA,AP

引入芳香指数作为代表“化合物芳香度”的值

芳香指数=芳香原子数(AP)/ 原子总数(HA)
 

HA是重原子

芳香比:ARR

几乎等同于Ar / HA的描述符是芳族比(ARR

芳族比率=分子中
 

文章来源: drugai.blog.csdn.net,作者:DrugAI,版权归原作者所有,如需转载,请联系作者。

原文链接:drugai.blog.csdn.net/article/details/102524904

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