RDKit | 统计分子库中某种元素出现的次数

导入库

      import pandas as pd
      from rdkit import Chem
      from rdkit.Chem import rdMolDescriptors
      from rdkit.Chem import Draw
      import numpy as np
      import warnings
      warnings.filterwarnings("ignore")
  
 

载入数据

df = pd.read_csv('smiles.csv')
 

将smiles转换为RDKit的mol对象

df['mol'] = df['smiles'].apply(lambda x: Chem.MolFromSmiles(x))
 

绘制结构

Draw.MolsToGridImage(df['mol'][:5], molsPerRow=5, legends=list(df['smiles'][:5].values))
 

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