RDKit | 天然产物的相似度评分(NP-likeness)

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DrugAI 发表于 2021/07/15 05:01:43 2021/07/15
【摘要】         天然产物在药物发现的历史上占有非常重要的地位,许多药物仍然是天然产物及其衍生物。因此,过去大型制药公司都拥有“天然产物化学”部门,但是低通量天然产物的筛选逐渐变得无利可图并被关闭。         与药物发现化学中通常合成的化合物相比,天然产物的结构特征为: 许多稠密的环结...

        天然产物在药物发现的历史上占有非常重要的地位,许多药物仍然是天然产物及其衍生物。因此,过去大型制药公司都拥有“天然产物化学”部门,但是低通量天然产物的筛选逐渐变得无利可图并被关闭。

        与药物发现化学中通常合成的化合物相比,天然产物的结构特征为:

  • 许多稠密的环结构
  • 许多不对称中心
  • 芳香环更少,sp3碳更多
  • 氧原子百分比高,氮原子百分比低

 

天然产物化合物的特征

为了将“ 天然产物相似性 ”用作库设计的指标,有必要了解天然产物化合物的特征。与合成化合物相比,天然产物的结构如前所述:

  • 许多稠密的环结构

文章来源: drugai.blog.csdn.net,作者:DrugAI,版权归原作者所有,如需转载,请联系作者。

原文链接:drugai.blog.csdn.net/article/details/102593918

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