RDKit | 基于RDKit输出分子结构图（Image）的方法

RDKit内置功能绘制分子结构的函数，可根据rdkit.Chem.Draw包创建分子图像

方法一：基于SMILES输出分子2D图（2D image）

导入库

  

   

    

     

    
    

     

      from rdkit import Chem
     
    
   

    

     

    
    

     

      from rdkit.Chem import Draw
     
    
   

    

     

    
    

     

      from rdkit.Chem import rdDepictor
     
    
  
 

载入smiles数据

mol = Chem.MolFromSmiles('CCC(CC)O[C@@H]1C=C(C[C@@H]([C@H]1NC(=O)C)[NH3+])C(=O)OCC')
 

计算2D坐标

rdDepictor.Compute2DCoords(mol)
 

输出分子图

文章来源: drugai.blog.csdn.net，作者：DrugAI，版权归原作者所有，如需转载，请联系作者。

原文链接：drugai.blog.csdn.net/article/details/103855314