RDKit | 基于RDKit的MaxMin方法选择高度多样化的库

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DrugAI 发表于 2021/07/15 02:38:50 2021/07/15
【摘要】 建立高度多样化的库有四种方法, 聚类方法 基于距离的方法 基于分类的方法 使用优化方法的方法 这次使用RDKit中实现的MaxMin方法作为“ 基于距离的方法” 来构建各种库。   基于距离的方法概述 聚类方法中 将数据集划分为指定数量的集群 从每个簇中选择分子 分两个阶段选择了分子。另一方面,本研究中使用的基于距离的Ma...

建立高度多样化的库有四种方法,

  1. 聚类方法
  2. 基于距离的方法
  3. 基于分类的方法
  4. 使用优化方法的方法

这次使用RDKit中实现的MaxMin方法作为“ 基于距离的方法” 来构建各种库。

 

基于距离的方法概述

聚类方法中

  1. 将数据集划分为指定数量的集群
  2. 从每个簇中选择分子

分两个阶段选择了分子。另一方面,本研究中使用的基于距离的MaxMin方法中,一步选择分子。

 

RDKit中MaxMin方法的实现

rdkit.SimDivFilters.rdSimDivPickers.MaxMinPicker

        用于选择各种各样的RDKit化合物的

文章来源: drugai.blog.csdn.net,作者:DrugAI,版权归原作者所有,如需转载,请联系作者。

原文链接:drugai.blog.csdn.net/article/details/104799229

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