RDKit | 通过Lipinski规则了解如何在RDKit中处理描述符

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DrugAI 发表于 2021/07/15 01:37:05 2021/07/15
【摘要】 以Lipinski的为主题,学习RDKit如何处理表征分子特性的“ 描述符 ”。   描述符         描述符是确定分子性质的指标。当然,水的性质是水的溶解度和大小的性质,生物活性的存在或不存在也可以说是自然的。特别是在化学信息学领域,可以从分子结构衍生的那些被描述符进行属性描述。 &nbsp...

以Lipinski的为主题,学习RDKit如何处理表征分子特性的“ 描述符 ”。

 

描述符

        描述符是确定分子性质的指标。当然,水的性质是水的溶解度和大小的性质,生物活性的存在或不存在也可以说是自然的。特别是在化学信息学领域,可以从分子结构衍生的那些被描述符进行属性描述。

        许多情况下,使用描述符的目的是通过组合多个描述符来了解实验数据(例如生物活性),并最终创建一个用于预测的模型(QSAR模型)。已经开发了许多描述符,并将在将来继续使用。

 

通过Lipinski规则了解如何在RDKit中处理描述符

导入库


  
  1. import pandas as pd
  2. import seaborn as sns
  3. from rdkit import rdBase, Chem
  4. print(rdBase.rdkitVersion)
  5. from rdkit.Chem import AllChem, Descriptors

载入数据

suppl 
 

文章来源: drugai.blog.csdn.net,作者:DrugAI,版权归原作者所有,如需转载,请联系作者。

原文链接:drugai.blog.csdn.net/article/details/104794999

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