RDKit | RDKit中处理分子Mol对象

RDKit中处理分子Mol对象

导入库

  

   

    

     

    
    

     

      from rdkit import rdBase, Chem
     
    
   

    

     

    
    

     

      from rdkit.Chem import AllChem, Draw
     
    
   

    

     

    
    

     

      print('rdkit version: {}'.format(rdBase.rdkitVersion))
     
    
  
 

载入数据

  

   

    

     

    
    

     

      suppl = Chem.SDMolSupplier('sdf_20191011152835.sdf')
     
    
   

    

     

    
    

     

      mols = [x for x in suppl if x is not None]
     
    
   

    

     

    
    

     

      len(mols)
     
    
  
 

Mol对象的组成

由于Mol对象是分子，因此它们是由原子组成的。分子是通过原子间键的形成而形成的。RDKit的Mol对象准备了Atom对象和Bond对象。

Atom和Bond对象相互链接，

• 绑定Atom对象形式的
• 哪些原子在键对象中形成键

文章来源: drugai.blog.csdn.net，作者：DrugAI，版权归原作者所有，如需转载，请联系作者。

原文链接：drugai.blog.csdn.net/article/details/104795526