RDKit | 基于scikit-learn将pytorch用于QSAR模型构建
【摘要】 将PyTorch用于深度学习框架。PyTorch非常灵活,并且有很多文章将其用于实现。
利用scikit-learn一样调用fit来训练pytorch模型,使用skorch可以使训练过程变得简单。
skorch
skorch 一个基于pytorch封装兼容scikit-learn的神经网络库
skorch 安装
pip install skorch...
将PyTorch用于深度学习框架。PyTorch非常灵活,并且有很多文章将其用于实现。
利用scikit-learn一样调用fit来训练pytorch模型,使用skorch可以使训练过程变得简单。
skorch
skorch 一个基于pytorch封装兼容scikit-learn的神经网络库
skorch 安装
pip install skorch
QSAR模型构建
导入库
import os
from rdkit import Chem
from rdkit import RDPaths
from rdkit.Chem import AllChem
from rdkit.Chem import DataStructs
import numpy as np
trainsdf = os.path.join(RDPaths.RDDocsDir, 'Book/data/solubility.train.sdf')
testsdf =
文章来源: drugai.blog.csdn.net,作者:DrugAI,版权归原作者所有,如需转载,请联系作者。
原文链接:drugai.blog.csdn.net/article/details/104949815
【版权声明】本文为华为云社区用户转载文章,如果您发现本社区中有涉嫌抄袭的内容,欢迎发送邮件进行举报,并提供相关证据,一经查实,本社区将立刻删除涉嫌侵权内容,举报邮箱:
cloudbbs@huaweicloud.com
- 点赞
- 收藏
- 关注作者
作者其他文章
评论(0)