RDKit | RDKit（2019.09）新增相似性图函数

RDKit（2019.09）新增相似性图函数

导入库

  

   

    

     

    
    

     

      from rdkit import Chem
     
    
   

    

     

    
    

     

      from rdkit.Chem import Draw
     
    
   

    

     

    
    

     

      from rdkit.Chem.Draw import SimilarityMaps
     
    
   

    

     

    
    

     

      from IPython.display import SVG
     
    
   

    

     

    
    

     

      import numpy as np
     
    
   

    

     

    
    

     

      import rdkit
     
    
   

    

     

    
    

     

      print(rdkit.__version__)
     
    
  
 

2020.03.1

绘制分子

  

   

    

     

    
    

     

      atorvastatin = Chem.MolFromSmiles('O=C(O)C[C@H](O)C[C@H](O)CCn2c(c(c(c2c1ccc(F)cc1)c3ccccc3)C(=O)Nc4ccccc4)C(C)C')
     
    
   

    

     

    
    

     

      rosuvastatin = Chem.MolFromSmiles('OC(=O)C[C@H](O)C[C@H](O)\C=C\c1c(C(C)C)nc(N(C)S(=O)(=O)C)nc1c2ccc(F)cc2')
     
    
   

    

     

    
    

     

      Draw.MolsToGridImage((atorvastatin,rosuvastatin))
     
    
  
 

基于Morgan指纹的相似图

文章来源: drugai.blog.csdn.net，作者：DrugAI，版权归原作者所有，如需转载，请联系作者。

原文链接：drugai.blog.csdn.net/article/details/105771798