MOSES | 分子生成模型的基准平台

MOSES简介

深度生成模型因发现新的分子和材料而迅速流行。 这样的模型可以从大量的分子结构中学习并产生新的化合物。 这项工作中介绍了分子集（MOSES），一个基准平台，可支持针对药物发现的机器学习研究。 MOSES实现了几种流行的分子生成模型，并提供了一组指标来评估所生成分子的质量和多样性。 借助MOSES，旨在标准化分子生成研究，并促进新模型的共享和比较。

MOSES安装

pip install molsets
 

MOSES示例

导入库

  

   

    

     

    
    

     

      import pandas as pd
     
    
   

    

     

    
    

     

      from rdkit import Chem
     
    
   

    

     

    
    

     

      from moses.metrics import get_all_metrics
     
    
  
 

载入数据

  

   

    

     

    
    

     

      gen = ['CNC', 'Oc1ccccc1-c1cccc2cnccc12',
     
    
   

    

     

    
    

     
 'CCCP',
     
    
   

    

     

    
    

     
 'Cc1noc(C)c1CN(C)C(=O)Nc1cc(F)cc(F)c1',
     
    
   

    

     

    
    

     
 'Cc1nc(NCc2ccccc2)no1-c1ccccc1']
     
    
  
 

评估

get_all_metrics(gen)<
 

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