RDKit | 将rdMolDraw2D和RDKit生成的结构图输出到Excel

环境

• Windows10
• Python3.6.8
• RDKit 2020.03.3

导入库 

      from rdkit import Chem
      from rdkit.Chem import Draw, AllChem
      from rdkit.Chem.Draw import rdMolDraw2D
      from IPython.display import SVG
      from rdkit.Chem import PandasTools
      import pandas as pd
      import numpy as np
      from io import BytesIO
      import copy
      import xlsxwriter
      from PIL import Image, ImageFilter
      from cairosvg import svg2png
      import argparse
  
 

定义分子对象产生图片的函数

      def generate_image(mol, size):
       image_data = BytesIO()
       view = rdMolDraw2D.MolDraw2DSVG(size[0], size[1])
       tm = rdMolDraw2D.PrepareMolForDrawing(mol)
       view.DrawMolecule(tm)
       view.FinishDrawing()
       svg = view.GetDrawingTe
  
 

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