RDKit | 基于R基团分解(R-group decomposition)高亮分子

一组共享一个共同骨架的分子上做R基分解（RGD，R-group decomposition），为那些对准骨架的分子生成坐标，并生成分子图像，其中的R基团被涂上了颜色，使它们容易被挑选出来。

注：RDKit版本≥2020.09.1

导入库

      import rdkit
      from rdkit import Chem
      from rdkit.Chem import Draw
      from rdkit.Chem.Draw import IPythonConsole
      IPythonConsole.molSize=(450,350)
      from rdkit.Chem import rdRGroupDecomposition
      from rdkit.Chem import rdqueries
      from rdkit.Chem import rdDepictor
      from rdkit.Chem.Draw import rdMolDraw2D
      from rdkit import Geometry
      rdDepictor.SetPreferCoordGen(True)
      import pandas as pd
      from IPython.display import SVG,Image
      from ipywidgets import interact
      print(rdkit.__version__)
  
 

2020.09.1

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