万万没想到，云原生基础设施还能加速农作物基因测序

基因研究一直是农作物科学领域的一大高地，基因测序工程集合了DNA聚合酶、纳米技术、高性能计算等领域尖端科技，进行农作物全品种基因测序，对推动农业发展、增加作物产量，起到关键作用。

然而，基因测序工程，动辄需要数万/数十万个基因测序及模型建立，需要大量的计算和存储资源，常见的基因转换、拼接、对比、注释全流程，用一台高性能服务器运行耗时30多个小时，数万乃至十万级的基因测序任务，对网络、存储、算力，以及业务响应的及时性、可靠性、安全性有极高的要求。尤其是随着第三代测序的推广，在极大提升了测序准确性的同时，对计算资源也需求增长了数百倍，自建数据中心进行基因测序，在技术、建设周期和投资成本、运维成本上都面临巨大的挑战。

早在2018年，华为云就针对基因测序行业所面临的困难，提供基于容器技术的解决方案，并发布了基因容器服务（Gene Container Service, GCS）。今年，综合基因测序、AI、大数据、HPC等场景的共性诉求，华为云将基因容器全面升级容器批量计算服务（Batch Container Engine，BCE），为基因测序提供更高效、更易用、极致性价比的解决方案。

容器批量计算服务基于云容器引擎（CCE）、云容器实例（CCI）、智能边缘平台（IEF）等基础设施，提供多集群、多任务/异构资源混合调度能力，并支持多队列管理，让多业务应用规划更便捷。相比于传统批量任务处理方案，容器批量计算服务在性能、调度、运维、成本等方面都具备明显优势：

◆ 更高效 任务处理性能提升30%以上

面向容器/应用的调度算法优化，TPC-DS测试较原生K8s效率提升30%以上，调度性能1000 PODs/秒 ,业界平均水平的十倍，同时支持跨Region进行资源调度，保障算力充足可用。

◆ 更易用 开箱即用免运维

通过自动统一的资源管理，屏蔽复杂的环境依赖，用户不用考虑环境维护成本，仅需要将精力专注在应用本身，开箱即用，一处部署，处处可用。

◆ 极致性价比 实现性能与成本的最佳平衡

基于容器技术，提供秒级弹性伸缩能力，扩容速度可达30秒扩容8000核，在流量突增时能快速弹性扩容，保障业务的连续性和高稳定性，通过按秒计费策略实现成本的精细化管理。

◆ 丰富的硬件生态 满足不同场景的差异化算力诉求

容器批量计算支持 X86、鲲鹏、昇腾、GPU等多样化算力集群的混合部署，结合业务特点，灵活分配资源，同时支持推理流量多种分发策略，可使综合成本降低30%。

基于容器批量计算，华为云还推出了云原生高性能计算解决方案，并与生物、医疗等各行业知名厂商合作，形成面向不同细化领域的行业化解决方案：

◆ 华大基因：云原生高性能计算解决方案为华大基因提供云端基因测序解决方案,通过对常用的软件优化,更好的支撑DNA、RNA、液态活检等主流生物基因测序场景。

◆ 武汉希望组：利用三代测序优势，并采用5G传输、云原生高性能计算解决方案作为分析引擎和算力资源池，构建全流程的病毒基因组实时分析平台，适合在大范围内同时开展疫情的检测工作。

◆ 金橡医学：基于云原生高性能计算解决方案打造的全容器基因测序解决方案，使得将有限的资金实现最大化利用，助力金橡医学在市场上占得先机。

◆ 上海生科院：VIC（Virus Identification Cloud）得到云原生高性能计算解决方案强大计算能力的支持，可提供高通量多样本并行云端分析能力，助力临床诊断，还可监测病毒变异趋势。

云原生高性能计算解决方案以应用为中心，并基于华为云擎天架构的深度软硬协同能力，为业务提供多元算力、极致性能、极致体验的云原生基础设施，还再次升级了企业应用架构，统一企业在线与离线业务的运行平台，简化业务运维、提升资源利用率，进一步加速了企业业务敏捷创新，目前已经在AI、大数据、视频转码等领域得到广泛应用。