鲲鹏服务器上源码部署基因测序软件kentUtils
【摘要】 kentUtils是与UCSC基因组浏览器结合使用的一系列生物信息学实用程序。1 安装准备华为云购买一台鲲鹏服务器本文以云服务器KC1实例搭建，云服务器配置如表1-1所示。 表1-1 云服务器配置项目说明规格kc1.large.2 | 2vCPUs | 4GB磁盘系统盘：高IO（40GB） 表1-2 CentOS操作系统要求项目说明下载地址CentOS7.6在公共镜像中已提供。K...
kentUtils是与UCSC基因组浏览器结合使用的一系列生物信息学实用程序。
1 安装准备
华为云购买一台鲲鹏服务器
本文以云服务器KC1实例搭建，云服务器配置如表1-1所示。
表1-1 云服务器配置
项目 |
说明 |
规格 |
kc1.large.2 | 2vCPUs | 4GB |
磁盘 |
系统盘：高IO（40GB） |
项目 |
说明 |
下载地址 |
CentOS |
7.6 |
在公共镜像中已提供。 |
Kernel |
4.14.0-115 |
在公共镜像中已提供。 |
2 配置编译环境
安装依赖。
yum install zlib-devel openssl-devel libpng-devel mysql-devel -y
3 获取源码
cd /usr/local/src wget https://github.com/ENCODE-DCC/kentUtils/archive/v302.1.0.tar.gz -O kentUtils-302.1.0.tar.gz
4 编译和安装
tar -zxvf kentUtils-302.1.0.tar.gz cd kentUtils-302.1.0 make -j4
5 运行和验证
查看工具集
cd /usr/local/src/kentUtils-302.1.0/bin ls
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