鲲鹏服务器上源码部署基因测序软件kentUtils

举报
鲲鹏小玩家 发表于 2020/07/17 11:27:11 2020/07/17
【摘要】 kentUtils是与UCSC基因组浏览器结合使用的一系列生物信息学实用程序。1 安装准备华为云购买一台鲲鹏服务器本文以云服务器KC1实例搭建,云服务器配置如表1-1所示。 表1-1 云服务器配置项目说明规格kc1.large.2 | 2vCPUs | 4GB磁盘系统盘:高IO(40GB) 表1-2 CentOS操作系统要求项目说明下载地址CentOS7.6在公共镜像中已提供。K...

kentUtils是与UCSC基因组浏览器结合使用的一系列生物信息学实用程序。

1       安装准备

华为云购买一台鲲鹏服务器

本文以云服务器KC1实例搭建,云服务器配置如表1-1所示。

 

1-1 云服务器配置

项目

说明

规格

kc1.large.2 | 2vCPUs | 4GB

磁盘

系统盘:高IO40GB

 

1-2 CentOS操作系统要求

项目

说明

下载地址

CentOS

7.6

在公共镜像中已提供。

Kernel

4.14.0-115

在公共镜像中已提供。

 

2       配置编译环境

安装依赖。

yum install zlib-devel openssl-devel libpng-devel mysql-devel -y

 

3       获取源码

cd /usr/local/src
wget https://github.com/ENCODE-DCC/kentUtils/archive/v302.1.0.tar.gz -O kentUtils-302.1.0.tar.gz

 

4       编译和安装

tar -zxvf kentUtils-302.1.0.tar.gz
cd kentUtils-302.1.0
make -j4

 

5       运行和验证

查看工具集

cd /usr/local/src/kentUtils-302.1.0/bin
ls


【版权声明】本文为华为云社区用户原创内容,转载时必须标注文章的来源(华为云社区)、文章链接、文章作者等基本信息, 否则作者和本社区有权追究责任。如果您发现本社区中有涉嫌抄袭的内容,欢迎发送邮件进行举报,并提供相关证据,一经查实,本社区将立刻删除涉嫌侵权内容,举报邮箱: cloudbbs@huaweicloud.com
  • 点赞
  • 收藏
  • 关注作者

评论(0

0/1000
抱歉,系统识别当前为高风险访问,暂不支持该操作

全部回复

上滑加载中

设置昵称

在此一键设置昵称,即可参与社区互动!

*长度不超过10个汉字或20个英文字符,设置后3个月内不可修改。

*长度不超过10个汉字或20个英文字符,设置后3个月内不可修改。

举报
请填写举报理由
0/200