鲲鹏云服务器安装miranda

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姮柏芃 发表于 2020/06/16 19:32:44 2020/06/16
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【摘要】 miRanda是一种用于寻找microRNA基因组靶标的算法。该算法已用C语言编写,可以作为GPL下的开源方法使用。

miRanda是一种用于寻找microRNA基因组靶标的算法。该算法已用C语言编写,可以作为GPL下的开源方法使用。

开发语言:C/C++

环境要求

云服务器要求

本文以云服务器KC1实例测试,云服务器配置如表 云服务器配置所示。

表1 云服务器配置

项目

说明

规格

kc1.large.2 | 4vCPUs | 8GB

磁盘

系统盘:高IO(40GB)

操作系统要求

操作系统要求如表 操作系统要求所示。

表1 操作系统要求

项目

说明

下载地址

CentOS

7.6

在公共镜像中已提供。

Kernel

4.14.0-115

在公共镜像中已提供。

配置编译环境

安装相关依赖。

yum install -y wget

获取源码

获取“miRanda-3.3a”源码包。

cd /usr/local/src

wget http://cbio.mskcc.org/microrna_data/miRanda-aug2010.tar.gz

编译和安装

  1. 解压并进入源码包。

    tar -zxvf miRanda-aug2010.tar.gz

    cd miRanda-3.3a

  2. 生成Makefile文件。

    ./configure --prefix=/usr/local/miRanda --host=arm-linux --build=arm-linux

  3. 编译安装miRanda。

    make -j4 && make install

运行和验证。

查看miRanda版本信息。

/usr/local/miRanda/bin/miranda --version

回显类似如下信息代表miRanda安装成功。

=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=miranda v3.3a     microRNA Target Scanning Algorithm=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-==-=-=-=-=-=-=
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