鲲鹏云服务器安装miranda
【摘要】 miRanda是一种用于寻找microRNA基因组靶标的算法。该算法已用C语言编写，可以作为GPL下的开源方法使用。
miRanda是一种用于寻找microRNA基因组靶标的算法。该算法已用C语言编写，可以作为GPL下的开源方法使用。
开发语言：C/C++
环境要求
云服务器要求
本文以云服务器KC1实例测试，云服务器配置如表 云服务器配置所示。
项目 |
说明 |
规格 |
kc1.large.2 | 4vCPUs | 8GB |
磁盘 |
系统盘：高IO（40GB） |
操作系统要求
操作系统要求如表 操作系统要求所示。
项目 |
说明 |
下载地址 |
CentOS |
7.6 |
在公共镜像中已提供。 |
Kernel |
4.14.0-115 |
在公共镜像中已提供。 |
配置编译环境
安装相关依赖。
yum install -y wget
获取源码
获取“miRanda-3.3a”源码包。
cd /usr/local/src
wget http://cbio.mskcc.org/microrna_data/miRanda-aug2010.tar.gz
编译和安装
解压并进入源码包。
tar -zxvf miRanda-aug2010.tar.gz
cd miRanda-3.3a
生成Makefile文件。
./configure --prefix=/usr/local/miRanda --host=arm-linux --build=arm-linux
编译安装miRanda。
make -j4 && make install
运行和验证。
查看miRanda版本信息。
/usr/local/miRanda/bin/miranda --version
回显类似如下信息代表miRanda安装成功。
=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=miranda v3.3a microRNA Target Scanning Algorithm=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-==-=-=-=-=-=-=
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