鲲鹏云服务器源码安装randfold
【摘要】 randfold是一个独立的基因测序相关软件，它从原始序列开始随机显示其核苷酸顺序。它根据改组后的序列计算推断结构的最小自由能（MFE），并多次重复计算以建立最小自由能（MFE）值的分布。
randfold是一个独立的基因测序相关软件，它从原始序列开始随机显示其核苷酸顺序。它根据改组后的序列计算推断结构的最小自由能（MFE），并多次重复计算以建立最小自由能（MFE）值的分布。
环境要求
云服务器要求
本文以云服务器KC1实例测试，云服务器配置如表 云服务器配置所示。
项目 |
说明 |
规格 |
kc1.large.2 | 4vCPUs | 8GB |
磁盘 |
系统盘：高IO（40GB） |
操作系统要求
操作系统要求如表 操作系统要求所示。
项目 |
说明 |
下载地址 |
CentOS |
7.6 |
在公共镜像中已提供。 |
Kernel |
4.14.0-115 |
在公共镜像中已提供。 |
配置编译环境
安装相关依赖。
yum install -y git
获取源码
获取“randfold”源码包。
cd /usr/local/
git clone https://github.com/eb00/randfold.git
编译和安装
编译randfold
cd randfold/src/squid-1.9g
./configure && make
编译randfold。
cd ../
make
编译完成后会生成可执行文件“randfold”。
设置软连接。
ln -s /usr/local/randfold/src/randfold /usr/bin/randfold
运行和验证
执行如下测试命令。
randfold -d let7.tfa 999
当系统回显类似如下信息是，表示randfold执行成功。
cel-let-7 -42.90 0.001000
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