鲲鹏云服务器安装Oases

简要介绍

Oases是一个转录组组装器，旨在没有任何基因组组装的情况下从短读测序技术生成转录本。

一句话描述：基因组装软件

开源协议：GPL3.0

建议的版本

建议使用版本为“oases-0.2.09”

环境要求

云服务器要求

本文以云服务器KC1实例测试，云服务器配置如表 云服务器配置所示。

操作系统要求

操作系统要求如表 操作系统要求所示。

配置编译环境

安装相关依赖

yum install -y git

获取源码

获取“oases最新版本”源码包。

cd /usr/local

git clone --recursive https://github.com/dzerbino/oases

编译和安装

1. 修改Makefile文件，将"/usr/local/oases/velvet/Makefile" CFLAG后面的“-m64”删除。

   修改前

   

   修改后

   

2. 
   

3. 编译oases

   make -j4

   编译完成后会在oases目录下生成可执行程序oases.

   
   

4. 设置软连接

   ln -s /usr/local/oases/oases /usr/bin/oases

运行和验证

1. 查看oases版本信息

   oases --version

   回显如下信息则表示subread安装成功

   oases 0.2.09